Schizosaccharomyces pombe (ASM294v2)
Description

F-box protein Pof6 [Source:PomBase;Acc:SPCC18.04]

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About this transcript

This transcript has 2 exons, is annotated with 9 domains and features and is associated with 34 variant alleles.

Gene

This transcript is a product of gene SPCC18.04 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
pof6SPCC18.04.12888872aa
 
Protein coding
O74854 -Ensembl Canonical
Codons
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  • Alternating codons
Exons
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     1 GAATACCTGTGATCATAATATCATGTTCGCTAGAACCAAATAGATTTCATGAATGAAGCC     60
       ....................................................ATGAAGCC      8
       ....................................................-M--K--P      3

                                                                          
    61 TTCGGAAGCTCGTGAACATGCCATAAGGAAGATTAAGGAGTATCTAGAAAGGCGACATAA    120
     9 TTCGGAAGCTCGTGAACATGCCATAAGGAAGATTAAGGAGTATCTAGAAAGGCGACATAA     68
     3 --S--E--A--R--E--H--A--I--R--K--I--K--E--Y--L--E--R--R--H--K     23

                                                                          
   121 ACAACAGTTTAAGGCTTTGTTTGGATGTCTCACGATCAATATATACTTAAAGATATTCAC    180
    69 ACAACAGTTTAAGGCTTTGTTTGGATGTCTCACGATCAATATATACTTAAAGATATTCAC    128
    23 --Q--Q--F--K--A--L--F--G--C--L--T--I--N--I--Y--L--K--I--F--T     43

                                                                          
   181 GCTCATTTCTACCCCAGATCTGTGTAATTGCCGCCTTGTTTGTAGAAAATTTCAACAATT    240
   129 GCTCATTTCTACCCCAGATCTGTGTAATTGCCGCCTTGTTTGTAGAAAATTTCAACAATT    188
    43 --L--I--S--T--P--D--L--C--N--C--R--L--V--C--R--K--F--Q--Q--L     63

                                                                          
   241 ATGTGATTACAATAGTATATATGTGAAAAAACTACTTCTTATGAATGCTTGGGATGTTAC    300
   189 ATGTGATTACAATAGTATATATGTGAAAAAACTACTTCTTATGAATGCTTGGGATGTTAC    248
    63 --C--D--Y--N--S--I--Y--V--K--K--L--L--L--M--N--A--W--D--V--T     83

                                                                          
   301 ACTTTCTCGAAAGCTTTATTATGAAAGTCAAGATGGGATGTCTCAAGCAAATATGTCTTC    360
   249 ACTTTCTCGAAAGCTTTATTATGAAAGTCAAGATGGGATGTCTCAAGCAAATATGTCTTC    308
    83 --L--S--R--K--L--Y--Y--E--S--Q--D--G--M--S--Q--A--N--M--S--S    103

                                                                          
   361 CAACACCAGCAAAGGCTTTCATTTACAAAGTAGTGATAAAAAGTATGCTGACTCTGATCG    420
   309 CAACACCAGCAAAGGCTTTCATTTACAAAGTAGTGATAAAAAGTATGCTGACTCTGATCG    368
   103 --N--T--S--K--G--F--H--L--Q--S--S--D--K--K--Y--A--D--S--D--R    123

                                                                          
   421 GCCTAAGCTGTCCTCCTCGTCACTTCTTTCCTTACCCGACCAAAAGATCCCTTTTCCTGT    480
   369 GCCTAAGCTGTCCTCCTCGTCACTTCTTTCCTTACCCGACCAAAAGATCCCTTTTCCTGT    428
   123 --P--K--L--S--S--S--S--L--L--S--L--P--D--Q--K--I--P--F--P--V    143

                                                                          
   481 TGATTACTCAACAGTGCAAGGGAAGCAAGTAGTTTTGACAGTTTTGGATTGTGTGAGTCA    540
   429 TGATTACTCAACAGTGCAAGGGAAGCAAGTAGTTTTGACAGTTTTGGATTGTGTGAGTCA    488
   143 --D--Y--S--T--V--Q--G--K--Q--V--V--L--T--V--L--D--C--V--S--Q    163

                                                                          
   541 AAGAGTTGAATTTGCAAGATTGGATTACATAAAGGTTTGGAGAGCATTGGCTCCTATCTA    600
   489 AAGAGTTGAATTTGCAAGATTGGATTACATAAAGGTTTGGAGAGCATTGGCTCCTATCTA    548
   163 --R--V--E--F--A--R--L--D--Y--I--K--V--W--R--A--L--A--P--I--Y    183

                                                                          
   601 CCGAAATCTGGCTTATGCTAGCAATACTATTGACCCTATTGCATTTTCTGCTTTTCGGAC    660
   549 CCGAAATCTGGCTTATGCTAGCAATACTATTGACCCTATTGCATTTTCTGCTTTTCGGAC    608
   183 --R--N--L--A--Y--A--S--N--T--I--D--P--I--A--F--S--A--F--R--T    203

                                                                          
   661 GCCAGAGGAGCAATCGAAAGTTCTGAAGTATTTAATTAGGTTTGGAAATTCTTATCCCTA    720
   609 GCCAGAGGAGCAATCGAAAGTTCTGAAGTATTTAATTAGGTTTGGAAATTCTTATCCCTA    668
   203 --P--E--E--Q--S--K--V--L--K--Y--L--I--R--F--G--N--S--Y--P--Y    223

                                                                          
   721 TGGAACTTATCGACAGGCGATGCAAAATGCCATTCTTGACATGGCTTCATTATTTGAGCA    780
   669 TGGAACTTATCGACAGGCGATGCAAAATGCCATTCTTGACATGGCTTCATTATTTGAGCA    728
   223 --G--T--Y--R--Q--A--M--Q--N--A--I--L--D--M--A--S--L--F--E--Q    243

                                                                          
   781 AGCTTGTCTTGATGAATTTGAATTAGGTCTTCATTCTCGTAATCTTGATCTTCTTCGTAA    840
   729 AGCTTGTCTTGATGAATTTGAATTAGGTCTTCATTCTCGTAATCTTGATCTTCTTCGTAA    788
   243 --A--C--L--D--E--F--E--L--G--L--H--S--R--N--L--D--L--L--R--K    263

                                                                          
   841 GTTTTCTCATGTTCTTCATGATTTTAGTGGTCCAAATGCATACGTGAGCATGTATCTAGC    900
   789 GTTTTCTCATGTTCTTCATGATTTTAGTGGTCCAAATGCATACGTGAGCATGTATCTAGC    848
   263 --F--S--H--V--L--H--D--F--S--G--P--N--A--Y--V--S--M--Y--L--A    283

                                                                          
   901 AAAGCAAACTGATTTTGTTAGGTCTTTCTTCCATTTTGATCCGTATAGTTTGTTTATTTC    960
   849 AAAGCAAACTGATTTTGTTAGGTCTTTCTTCCATTTTGATCCGTATAGTTTGTTTATTTC    908
   283 --K--Q--T--D--F--V--R--S--F--F--H--F--D--P--Y--S--L--F--I--S    303

                                                                          
   961 CAATAATCTAGAAGAAATTCACATTAATTGGAACATCTTGGAGTCTGTTGTTAACGACAC   1020
   909 CAATAATCTAGAAGAAATTCACATTAATTGGAACATCTTGGAGTCTGTTGTTAACGACAC    968
   303 --N--N--L--E--E--I--H--I--N--W--N--I--L--E--S--V--V--N--D--T    323

                                                                          
  1021 TATCAAGCTTTTAGAGTCGGAATCCAAATTCTCTGAAGCTACTTTACCTGAGCCTGAGCT   1080
   969 TATCAAGCTTTTAGAGTCGGAATCCAAATTCTCTGAAGCTACTTTACCTGAGCCTGAGCT   1028
   323 --I--K--L--L--E--S--E--S--K--F--S--E--A--T--L--P--E--P--E--L    343

                                                                          
  1081 TGTCCAGGTTCCTTATGCTAAAGACATTCTTGGAAATTCACTAAAAGACTATGTAATATC   1140
  1029 TGTCCAGGTTCCTTATGCTAAAGACATTCTTGGAAATTCACTAAAAGACTATGTAATATC   1088
   343 --V--Q--V--P--Y--A--K--D--I--L--G--N--S--L--K--D--Y--V--I--S    363

                                                                          
  1141 AATATGCGAGCATATTGGTGAAGAAGAGACCGAATTGTTCCTTGTTTTTATTTCTGGATT   1200
  1089 AATATGCGAGCATATTGGTGAAGAAGAGACCGAATTGTTCCTTGTTTTTATTTCTGGATT   1148
   363 --I--C--E--H--I--G--E--E--E--T--E--L--F--L--V--F--I--S--G--F    383

                                                                          
  1201 TTATGGCCTATGCAAGAAGTTTTTTTCGATTCCTAATGGACCGGCTTTAGTGGATACAAT   1260
  1149 TTATGGCCTATGCAAGAAGTTTTTTTCGATTCCTAATGGACCGGCTTTAGTGGATACAAT   1208
   383 --Y--G--L--C--K--K--F--F--S--I--P--N--G--P--A--L--V--D--T--I    403

                                                                          
  1261 TTTTCAACCGCAAATTGATATTTTCATTTCTCAGGAGTTACATTACTTTAAAACTGTTGG   1320
  1209 TTTTCAACCGCAAATTGATATTTTCATTTCTCAGGAGTTACATTACTTTAAAACTGTTGG   1268
   403 --F--Q--P--Q--I--D--I--F--I--S--Q--E--L--H--Y--F--K--T--V--G    423

                                                                          
  1321 CTGGTCGCTGGTTGATCAGTGGGACCAAAAGCTGGAAGAAAAAGAAGACGCTACAGAATG   1380
  1269 CTGGTCGCTGGTTGATCAGTGGGACCAAAAGCTGGAAGAAAAAGAAGACGCTACAGAATG   1328
   423 --W--S--L--V--D--Q--W--D--Q--K--L--E--E--K--E--D--A--T--E--C    443

                                                                          
  1381 CTTTTTTTACAAAAATGTCAGCCAGAATACTGCCAAAAATAATTTTTTGGAAACCTTTAA   1440
  1329 CTTTTTTTACAAAAATGTCAGCCAGAATACTGCCAAAAATAATTTTTTGGAAACCTTTAA   1388
   443 --F--F--Y--K--N--V--S--Q--N--T--A--K--N--N--F--L--E--T--F--K    463

                                                                          
  1441 AAACGTAATGCTGCTTCCAGTCTCTCTTTTTACAATACCGTCAGAAAACAATAGTGCATC   1500
  1389 AAACGTAATGCTGCTTCCAGTCTCTCTTTTTACAATACCGTCAGAAAACAATAGTGCATC   1448
   463 --N--V--M--L--L--P--V--S--L--F--T--I--P--S--E--N--N--S--A--S    483

                                                                          
  1501 TAATTTGGCTGAGAAAGCGATAGAGCAGAAAGAAGAAGAAGATCCAGAACTTTCAAAGTT   1560
  1449 TAATTTGGCTGAGAAAGCGATAGAGCAGAAAGAAGAAGAAGATCCAGAACTTTCAAAGTT   1508
   483 --N--L--A--E--K--A--I--E--Q--K--E--E--E--D--P--E--L--S--K--L    503

                                                                          
  1561 GGATGCTGCCCGATTTGTTCCTGCGAATATATATGTTTCTAAGGACCGATTGAAACATCT   1620
  1509 GGATGCTGCCCGATTTGTTCCTGCGAATATATATGTTTCTAAGGACCGATTGAAACATCT   1568
   503 --D--A--A--R--F--V--P--A--N--I--Y--V--S--K--D--R--L--K--H--L    523

                                                                          
  1621 CCCTACTACCGAATTAGCCGCGCAAGCTGCTGTATTGGACTCAAAACTTGAAGGTATCAG   1680
  1569 CCCTACTACCGAATTAGCCGCGCAAGCTGCTGTATTGGACTCAAAACTTGAAGGTATCAG   1628
   523 --P--T--T--E--L--A--A--Q--A--A--V--L--D--S--K--L--E--G--I--S    543

                                                                          
  1681 CACCATGTTTAGTTTGGAATTAGCTTTGAAAATCGTCCATCTTTGCAAAGTTAGTTTAGC   1740
  1629 CACCATGTTTAGTTTGGAATTAGCTTTGAAAATCGTCCATCTTTGCAAAGTTAGTTTAGC   1688
   543 --T--M--F--S--L--E--L--A--L--K--I--V--H--L--C--K--V--S--L--A    563

                                                                          
  1741 TCGTGCTAAAGTATTTATGGGTACCTCGGTTCCTCAAGATGATGATATTAAAGGGCTTTC   1800
  1689 TCGTGCTAAAGTATTTATGGGTACCTCGGTTCCTCAAGATGATGATATTAAAGGGCTTTC   1748
   563 --R--A--K--V--F--M--G--T--S--V--P--Q--D--D--D--I--K--G--L--S    583

                                                                          
  1801 GAAGGACTTATTCGTTCAGCTTCTGCGGGAGTTAGGTCAAGGCCACTTAAAGCATGGGTT   1860
  1749 GAAGGACTTATTCGTTCAGCTTCTGCGGGAGTTAGGTCAAGGCCACTTAAAGCATGGGTT   1808
   583 --K--D--L--F--V--Q--L--L--R--E--L--G--Q--G--H--L--K--H--G--F    603

                                                                          
  1861 TGATCGAGCAATCGAGCATCTCTCTTCTTTTGATCCTCGACGCGACTTTTCTAGTAATAC   1920
  1809 TGATCGAGCAATCGAGCATCTCTCTTCTTTTGATCCTCGACGCGACTTTTCTAGTAATAC   1868
   603 --D--R--A--I--E--H--L--S--S--F--D--P--R--R--D--F--S--S--N--T    623

                                                                          
  1921 TGTAGAGCCAGTGGTGAAATTTTTGGAGCTTATCAATGTTGGTGATATGATTCAGCAGAT   1980
  1869 TGTAGAGCCAGTGGTGAAATTTTTGGAGCTTATCAATGTTGGTGATATGATTCAGCAGAT   1928
   623 --V--E--P--V--V--K--F--L--E--L--I--N--V--G--D--M--I--Q--Q--M    643

                                                                          
  1981 GATGGATAGCTTTTTTAACGAAGAAATGAGTCCTATATGTGTGAAAGATGATATGTTTGA   2040
  1929 GATGGATAGCTTTTTTAACGAAGAAATGAGTCCTATATGTGTGAAAGATGATATGTTTGA   1988
   643 --M--D--S--F--F--N--E--E--M--S--P--I--C--V--K--D--D--M--F--D    663

                                                                          
  2041 CCCTGCAATTGCAGAAAAAAAAAAATTCGAGCAGCTTTTGGATGAACGGGCAGCTTTCGG   2100
  1989 CCCTGCAATTGCAGAAAAAAAAAAATTCGAGCAGCTTTTGGATGAACGGGCAGCTTTCGG   2048
   663 --P--A--I--A--E--K--K--K--F--E--Q--L--L--D--E--R--A--A--F--G    683

                                                                          
  2101 ATTACACAAAGGCATTAATGTTCTAATTGAGCATGCCGATTTTTTGCTGGAAACTAAAAC   2160
  2049 ATTACACAAAGGCATTAATGTTCTAATTGAGCATGCCGATTTTTTGCTGGAAACTAAAAC   2108
   683 --L--H--K--G--I--N--V--L--I--E--H--A--D--F--L--L--E--T--K--T    703

                                                                          
  2161 ACCAATGAATTTATTTAGTGACCAAACTATAGGTTCCATAACGAATACTATAGAGCCTAC   2220
  2109 ACCAATGAATTTATTTAGTGACCAAACTATAGGTTCCATAACGAATACTATAGAGCCTAC   2168
   703 --P--M--N--L--F--S--D--Q--T--I--G--S--I--T--N--T--I--E--P--T    723

                                                                          
  2221 AGCTGCTGCCAAAAATGTGGTTCAATTTTTAGGTTTCCACATGCGTATTCTAGTTGGAAG   2280
  2169 AGCTGCTGCCAAAAATGTGGTTCAATTTTTAGGTTTCCACATGCGTATTCTAGTTGGAAG   2228
   723 --A--A--A--K--N--V--V--Q--F--L--G--F--H--M--R--I--L--V--G--R    743

                                                                          
  2281 GGCCGATCATGAAATCCTTGATGTTTTTTATAAGGAAGTCGGAATGAGACTTTTCGATTC   2340
  2229 GGCCGATCATGAAATCCTTGATGTTTTTTATAAGGAAGTCGGAATGAGACTTTTCGATTC   2288
   743 --A--D--H--E--I--L--D--V--F--Y--K--E--V--G--M--R--L--F--D--S    763

                                                                          
  2341 CTTAACACGTTACATAAAATCTCATAAATTCAGTGTCGATGGCGGGCTAAAGTTACTCAG   2400
  2289 CTTAACACGTTACATAAAATCTCATAAATTCAGTGTCGATGGCGGGCTAAAGTTACTCAG   2348
   763 --L--T--R--Y--I--K--S--H--K--F--S--V--D--G--G--L--K--L--L--S    783

                                                                          
  2401 CGATTGTAATTTGTATTATGAATTCATTCACTCTCTTCATCAAAGCAGCCTTTTACCATA   2460
  2349 CGATTGTAATTTGTATTATGAATTCATTCACTCTCTTCATCAAAGCAGCCTTTTACCATA   2408
   783 --D--C--N--L--Y--Y--E--F--I--H--S--L--H--Q--S--S--L--L--P--Y    803

                                                                          
  2461 TTTTAAGACATTGAAGGAAATTGCCCATTTATTTATTATTGATGGAAAAAACGCCGAAGA   2520
  2409 TTTTAAGACATTGAAGGAAATTGCCCATTTATTTATTATTGATGGAAAAAACGCCGAAGA   2468
   803 --F--K--T--L--K--E--I--A--H--L--F--I--I--D--G--K--N--A--E--E    823

                                                                          
  2521 GATTGGAAAACTGGCTACCGATACTTCTCGATTTTCTAGCGCATTTCATACCGAAGAGGT   2580
  2469 GATTGGAAAACTGGCTACCGATACTTCTCGATTTTCTAGCGCATTTCATACCGAAGAGGT   2528
   823 --I--G--K--L--A--T--D--T--S--R--F--S--S--A--F--H--T--E--E--V    843

                                                                          
  2581 TTACGAAATCCTTCACAGTCGTATTGACTGGTTAAACATCAAATACGAAGTAGATAAAGT   2640
  2529 TTACGAAATCCTTCACAGTCGTATTGACTGGTTAAACATCAAATACGAAGTAGATAAAGT   2588
   843 --Y--E--I--L--H--S--R--I--D--W--L--N--I--K--Y--E--V--D--K--V    863

                                                                          
  2641 AATCCATGGACTGGCATGCTGTATAATGTAAATATTTTTTATTTTTTGTTCATATCCTTT   2700
  2589 AATCCATGGACTGGCATGCTGTATAATGTAA.............................   2619
   863 --I--H--G--L--A--C--C--I--M--*-.............................    872

                                                                          
  2701 TTTTGTTATTACCATACACTTTAAAAATGCATCTTGCTTTCTGCTTTAGGCTATAATGTT   2760
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2761 TGTTTAACAAATTCGTTTTTTGGACCTTTTTTAGGTTTGTGTCTATTATAATATCCTCTA   2820
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2821 AAAGTCAATCAATTTTAATGTCATAATAAATCATAAATGCAGTAGTTATTAAGGATAAAA   2880
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2881 GCCAAAAC                                                       2888
       ........                                                           
       ........