Ustilago maydis (Umaydis521_2.0)
Description

ubiquitin-ribosomal 60S subunit protein L40 fusion protein

Location
About this transcript

This transcript has 2 exons and is annotated with 22 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene UMAG_02440 Show transcript tableHide transcript table

Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • RefSeq
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
-KIS69926387128aa
 
Protein coding
A0A0D1E1V3 -Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGCAGATTTTCGTCAAGACTCTGACGGGTAAGACCATTACCCTTGAGGTGGAGTCCTCG     60
     1 ATGCAGATTTTCGTCAAGACTCTGACGGGTAAGACCATTACCCTTGAGGTGGAGTCCTCG     60
     1 -M--Q--I--F--V--K--T--L--T--G--K--T--I--T--L--E--V--E--S--S-     20

                                                                          
    61 GACACCATCGACAATGTCAAGGCCAAGATTCAGGACAAGGAGGGTATTCCCCCCGACCAG    120
    61 GACACCATCGACAATGTCAAGGCCAAGATTCAGGACAAGGAGGGTATTCCCCCCGACCAG    120
    21 -D--T--I--D--N--V--K--A--K--I--Q--D--K--E--G--I--P--P--D--Q-     40

                                                                          
   121 CAGCGCCTGATCTTCGCCGGTAAGCAGCTCGAGGATGGCCGCACCCTCTCGGACTACAAC    180
   121 CAGCGCCTGATCTTCGCCGGTAAGCAGCTCGAGGATGGCCGCACCCTCTCGGACTACAAC    180
    41 -Q--R--L--I--F--A--G--K--Q--L--E--D--G--R--T--L--S--D--Y--N-     60

                                                                          
   181 ATCCAGAAGGAATCGACCCTCCACCTTGTGCTCCGTCTGCGTGGTGGTATCATCGAGCCC    240
   181 ATCCAGAAGGAATCGACCCTCCACCTTGTGCTCCGTCTGCGTGGTGGTATCATCGAGCCC    240
    61 -I--Q--K--E--S--T--L--H--L--V--L--R--L--R--G--G--I--I--E--P-     80

                                                                          
   241 TCGCTCAAGGTGCTCGCCGGCAAGTACAACTGCGACAAGCAGATTTGCCGAAAGTGCTAC    300
   241 TCGCTCAAGGTGCTCGCCGGCAAGTACAACTGCGACAAGCAGATTTGCCGAAAGTGCTAC    300
    81 -S--L--K--V--L--A--G--K--Y--N--C--D--K--Q--I--C--R--K--C--Y-    100

                                                                          
   301 GCTCGTCTCCCTCCTCGTGCCACCAACTGCCGTAAGCGCAAGTGCGGTCACTCGTCGCAG    360
   301 GCTCGTCTCCCTCCTCGTGCCACCAACTGCCGTAAGCGCAAGTGCGGTCACTCGTCGCAG    360
   101 -A--R--L--P--P--R--A--T--N--C--R--K--R--K--C--G--H--S--S--Q-    120

                                                                          
   361 CTCCGACCCAAGAAGAAGTTGAAGTAA                                     387
   361 CTCCGACCCAAGAAGAAGTTGAAGTAA                                     387
   121 -L--R--P--K--K--K--L--K--*-                                     128