Schizosaccharomyces japonicus (GCA_000149845.2) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID History.
U4/U6 X U5 tri-snRNP complex subunit Snu66
SuperContig supercont5.2: 2,399,039-2,401,753 reverse strand.
This transcript has 3 exons and is annotated with 10 domains and features.
This transcript is a product of gene SJAG_04433 Show transcript tableHide transcript table
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1 AAAGAAACTCACCACCATGAAGCGTATCCGTCGCGAGTGCCTGGTAAGTACTAACGGGCG 60 ............................................................ ............................................................ 61 TGAGCGTGTCAGAGGCTAAAGTCGACGCGCGAAAAGCTGTACCCAGCTTCAGTGTGAGTA 120 ............................................................ ............................................................ 121 AATTTGCTTTCAACCATCATTTAGCCCACGGCCGGTAACAAATCAGCTTATAAGGCCATG 180 .........................................................ATG 3 .........................................................-M- 1 181 AGTGCTGTAAATCAGGCAACAGAATCTCTCTCCATAGATGAAACGAACAAACTTCGTATT 240 4 AGTGCTGTAAATCAGGCAACAGAATCTCTCTCCATAGATGAAACGAACAAACTTCGTATT 63 2 -S--A--V--N--Q--A--T--E--S--L--S--I--D--E--T--N--K--L--R--I- 21 241 TCTCTTGGTCTTAAACCTTTAGATGTAACAGGTGAAAAATCAGCGCCAGCCAACAAGGAT 300 64 TCTCTTGGTCTTAAACCTTTAGATGTAACAGGTGAAAAATCAGCGCCAGCCAACAAGGAT 123 22 -S--L--G--L--K--P--L--D--V--T--G--E--K--S--A--P--A--N--K--D- 41 301 GCAACAGATAAAAATGATGATTACGTTCAATCACAAATCCAGGAGGACGATGCCCTGGAA 360 124 GCAACAGATAAAAATGATGATTACGTTCAATCACAAATCCAGGAGGACGATGCCCTGGAA 183 42 -A--T--D--K--N--D--D--Y--V--Q--S--Q--I--Q--E--D--D--A--L--E- 61 361 AATTGGAAGCGAGAACAGCAACGTGCTGCCGAAGAACAAAAGCATAAAGAAGCAGAACTT 420 184 AATTGGAAGCGAGAACAGCAACGTGCTGCCGAAGAACAAAAGCATAAAGAAGCAGAACTT 243 62 -N--W--K--R--E--Q--Q--R--A--A--E--E--Q--K--H--K--E--A--E--L- 81 421 CGGCTGCAAAAGCTGAGGGCAGAAAGGGAGCGAAAGAAACTCCTTCAAAAAAAATCGCTT 480 244 CGGCTGCAAAAGCTGAGGGCAGAAAGGGAGCGAAAGAAACTCCTTCAAAAAAAATCGCTT 303 82 -R--L--Q--K--L--R--A--E--R--E--R--K--K--L--L--Q--K--K--S--L- 101 481 GCGGAGCTCTTGGAAGATGAAGAAGGTGCTGAGGAGGAAGACGCATTGAGTTGGGTGAAA 540 304 GCGGAGCTCTTGGAAGATGAAGAAGGTGCTGAGGAGGAAGACGCATTGAGTTGGGTGAAA 363 102 -A--E--L--L--E--D--E--E--G--A--E--E--E--D--A--L--S--W--V--K- 121 541 CGCACTCGTTCTCAAGTTCGTAAGTCAGTTTTATCGCCTTCTTCTACAACAAAATTGCAG 600 364 CGCACTCGTTCTCAAGTTCGTAAGTCAGTTTTATCGCCTTCTTCTACAACAAAATTGCAG 423 122 -R--T--R--S--Q--V--R--K--S--V--L--S--P--S--S--T--T--K--L--Q- 141 601 AAACCCGCTTCAACTACGAGTGTCGATTTGTCTAACAATTCAACGAGCCCAAAAAACTCT 660 424 AAACCCGCTTCAACTACGAGTGTCGATTTGTCTAACAATTCAACGAGCCCAAAAAACTCT 483 142 -K--P--A--S--T--T--S--V--D--L--S--N--N--S--T--S--P--K--N--S- 161 661 ACTCTTGAAGGTGTTCGCATAGCACACAATACTTCACAGCTTTCTTCCCCCGATGGTGTG 720 484 ACTCTTGAAGGTGTTCGCATAGCACACAATACTTCACAGCTTTCTTCCCCCGATGGTGTG 543 162 -T--L--E--G--V--R--I--A--H--N--T--S--Q--L--S--S--P--D--G--V- 181 721 TATCTTACACTCCGAGATGCCAATGTTCTGGATAACAACGGTGACGTCTTTGAAAGTGTC 780 544 TATCTTACACTCCGAGATGCCAATGTTCTGGATAACAACGGTGACGTCTTTGAAAGTGTC 603 182 -Y--L--T--L--R--D--A--N--V--L--D--N--N--G--D--V--F--E--S--V- 201 781 AGCCTAGTTGAACAGGAAACGACTGAAAGAAACGTTAAAGAACGATTACGGCAGCAGAGT 840 604 AGCCTAGTTGAACAGGAAACGACTGAAAGAAACGTTAAAGAACGATTACGGCAGCAGAGT 663 202 -S--L--V--E--Q--E--T--T--E--R--N--V--K--E--R--L--R--Q--Q--S- 221 841 TACGTCCCCTACGAAGATGAAACAACATTCAATGGCAGTGCATTGCTTCCACAGTACTCT 900 664 TACGTCCCCTACGAAGATGAAACAACATTCAATGGCAGTGCATTGCTTCCACAGTACTCT 723 222 -Y--V--P--Y--E--D--E--T--T--F--N--G--S--A--L--L--P--Q--Y--S- 241 901 AATGAAAAAAATCAAGGACTTTCTGAAACTGTTATAGGCGGTAACAACATCGTTCTTGAT 960 724 AATGAAAAAAATCAAGGACTTTCTGAAACTGTTATAGGCGGTAACAACATCGTTCTTGAT 783 242 -N--E--K--N--Q--G--L--S--E--T--V--I--G--G--N--N--I--V--L--D- 261 961 AGTACTCAGAAAATCAACACTGCCAACGCAACTCAAAATTCAGAAGCGCTCAGTCTGGAT 1020 784 AGTACTCAGAAAATCAACACTGCCAACGCAACTCAAAATTCAGAAGCGCTCAGTCTGGAT 843 262 -S--T--Q--K--I--N--T--A--N--A--T--Q--N--S--E--A--L--S--L--D- 281 1021 ACAGGTGAAGAGAAACAAATCACTGACTACCAAAGCATTAAAATAAAAAAGAGCAAACGG 1080 844 ACAGGTGAAGAGAAACAAATCACTGACTACCAAAGCATTAAAATAAAAAAGAGCAAACGG 903 282 -T--G--E--E--K--Q--I--T--D--Y--Q--S--I--K--I--K--K--S--K--R- 301 1081 AAAAAGCGGAAAGCAGTTCACCAACGCACCATCGACACAGTTGATGAAGTGGATGGCTCG 1140 904 AAAAAGCGGAAAGCAGTTCACCAACGCACCATCGACACAGTTGATGAAGTGGATGGCTCG 963 302 -K--K--R--K--A--V--H--Q--R--T--I--D--T--V--D--E--V--D--G--S- 321 1141 ACCACGGCAAACGAAAAAGAAGAGCAACTTACTCAGGAACATAAAAAATTTACTGTGAAA 1200 964 ACCACGGCAAACGAAAAAGAAGAGCAACTTACTCAGGAACATAAAAAATTTACTGTGAAA 1023 322 -T--T--A--N--E--K--E--E--Q--L--T--Q--E--H--K--K--F--T--V--K- 341 1201 GATGTTAACTTGAACATTAAATATAGGGCTTTCTATAATTCGTCGTTTGTAGACGACGAT 1260 1024 GATGTTAACTTGAACATTAAATATAGGGCTTTCTATAATTCGTCGTTTGTAGACGACGAT 1083 342 -D--V--N--L--N--I--K--Y--R--A--F--Y--N--S--S--F--V--D--D--D- 361 1261 GATCTTCAGAGCGCCCTTTCTACACGTCGGCAACAATTGCAAAGAAAGAGAGCACTAGAT 1320 1084 GATCTTCAGAGCGCCCTTTCTACACGTCGGCAACAATTGCAAAGAAAGAGAGCACTAGAT 1143 362 -D--L--Q--S--A--L--S--T--R--R--Q--Q--L--Q--R--K--R--A--L--D- 381 1321 GGTGAAAGTGTTGCTGATCAAGTCATGAAGTTACCAAGTCATTTGAAAATAGAGCATTTA 1380 1144 GGTGAAAGTGTTGCTGATCAAGTCATGAAGTTACCAAGTCATTTGAAAATAGAGCATTTA 1203 382 -G--E--S--V--A--D--Q--V--M--K--L--P--S--H--L--K--I--E--H--L- 401 1381 GACGGTACAGATAGCAATCCGGGACTCGTACTCGATGCCACAAGAACTTTTGTTGACGCT 1440 1204 GACGGTACAGATAGCAATCCGGGACTCGTACTCGATGCCACAAGAACTTTTGTTGACGCT 1263 402 -D--G--T--D--S--N--P--G--L--V--L--D--A--T--R--T--F--V--D--A- 421 1441 TTGGAAAATAAGAACGTTGTCGTTACTTCCCCCGAGCCTATGTCACACAATAATCAGACT 1500 1264 TTGGAAAATAAGAACGTTGTCGTTACTTCCCCCGAGCCTATGTCACACAATAATCAGACT 1323 422 -L--E--N--K--N--V--V--V--T--S--P--E--P--M--S--H--N--N--Q--T- 441 1501 AATGAAGACGGCGTTCCGGCTGCGAAGTTATCAATTAATGAGAAGACTGCAGATGCTTTT 1560 1324 AATGAAGACGGCGTTCCGGCTGCGAAGTTATCAATTAATGAGAAGACTGCAGATGCTTTT 1383 442 -N--E--D--G--V--P--A--A--K--L--S--I--N--E--K--T--A--D--A--F- 461 1561 GATACAGCAAATGAACAAAATAACGGAATGGATGCAGAGGAAAATGCCATTGAAGAATCG 1620 1384 GATACAGCAAATGAACAAAATAACGGAATGGATGCAGAGGAAAATGCCATTGAAGAATCG 1443 462 -D--T--A--N--E--Q--N--N--G--M--D--A--E--E--N--A--I--E--E--S- 481 1621 TTAGTTTCCAAAGGTGTTGGCACAGTTCTAAATATTCTTAAACAAAAGGGAGTTGTGAAA 1680 1444 TTAGTTTCCAAAGGTGTTGGCACAGTTCTAAATATTCTTAAACAAAAGGGAGTTGTGAAA 1503 482 -L--V--S--K--G--V--G--T--V--L--N--I--L--K--Q--K--G--V--V--K- 501 1681 TTACAGAATGATGCTTACGATCGTGTGCGACGGGAACAACTGTACACACAATGGGTTGCA 1740 1504 TTACAGAATGATGCTTACGATCGTGTGCGACGGGAACAACTGTACACACAATGGGTTGCA 1563 502 -L--Q--N--D--A--Y--D--R--V--R--R--E--Q--L--Y--T--Q--W--V--A- 521 1741 AAAAAGCGTCTGCTTCGCGCTGAACTTGAAGATAAGCGGCAAAGAGAGTTGTATGCTAAG 1800 1564 AAAAAGCGTCTGCTTCGCGCTGAACTTGAAGATAAGCGGCAAAGAGAGTTGTATGCTAAG 1623 522 -K--K--R--L--L--R--A--E--L--E--D--K--R--Q--R--E--L--Y--A--K- 541 1801 AGAGAGAATGAAAAATGGGATAAGATGGTTGCGGAACTTGAAATGGAACAATTTCAGGAT 1860 1624 AGAGAGAATGAAAAATGGGATAAGATGGTTGCGGAACTTGAAATGGAACAATTTCAGGAT 1683 542 -R--E--N--E--K--W--D--K--M--V--A--E--L--E--M--E--Q--F--Q--D- 561 1861 TACAAGCCGGAGATTAACCTACGTTACGTCGATGAGTTTGGACAGGAATTGGGTCCAAAA 1920 1684 TACAAGCCGGAGATTAACCTACGTTACGTCGATGAGTTTGGACAGGAATTGGGTCCAAAA 1743 562 -Y--K--P--E--I--N--L--R--Y--V--D--E--F--G--Q--E--L--G--P--K- 581 1921 GAAGCTTACAAGTACCTGCTTTCGCATCAATTTCACGGTAAGGGTTCAGGAAAAGCTAAG 1980 1744 GAAGCTTACAAGTACCTGCTTTCGCATCAATTTCACGGTAAGGGTTCAGGAAAAGCTAAG 1803 582 -E--A--Y--K--Y--L--L--S--H--Q--F--H--G--K--G--S--G--K--A--K- 601 1981 ACTGAAAAACGGTTAAAAAAAATCGAGGAAATAGAAAAGAACGAGAGAAAACCCATTTTC 2040 1804 ACTGAAAAACGGTTAAAAAAAATCGAGGAAATAGAAAAGAACGAGAGAAAACCCATTTTC 1863 602 -T--E--K--R--L--K--K--I--E--E--I--E--K--N--E--R--K--P--I--F- 621 2041 TAAAACTCAACATGATTATTCATCTTTCAGAGTCCATATTTCTTTGAAACTTCAGTTGGT 2100 1864 TAA......................................................... 1866 -*-......................................................... 621 2101 ATGCAATATCTGGGATCAATCGGTTTTAGGTCTGGATGGCCTAATAGCGCGAGGCCCGCA 2160 ............................................................ ............................................................ 2161 AGGGAAAAGCATGTATGATAAACGTCAGCAACGTCTTCCTTTCTGTCCGAGAAGCCCCCG 2220 ............................................................ ............................................................ 2221 CTGTCCGGATCTTGACATGTTTTTATAAATTCAATCAACTTTTCCCGATCAATCCAGTCA 2280 ............................................................ ............................................................ 2281 ATCTTGTTTATAATTGCTAGAGGTGAAAGAATCCACCAGGAGTAGCAAGACTGCGCATTG 2340 ............................................................ ............................................................ 2341 CCCGTTAGAAACGCGCGCTTTATACTAATATCCTTTACTTACATCGGGAAGCTTTTCAGG 2400 ............................................................ ............................................................ 2401 TCGACCATTTAATCCGCCGGAATTAACTTGTCGTTCACTAAGCCACCAGCCAAGAAAGTT 2460 ............................................................ ............................................................ 2461 CTCATCAATTTGGTCCAATTTTCTCAGGATAGCAAGAGCTGCAACACATGTGAAAACTAA 2520 ............................................................ ............................................................ 2521 TTTGACCAGGTTAGATTAATAAAGTTGTAACATATTTTTGTACCATA 2567 ............................................... ...............................................
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