Saccharomyces cerevisiae (R64-1-1)
Description

Protein involved in Arf3p regulation and in transcription regulation; localizes to the nucleus and to endocytic patches; contains an N-terminal Zn-finger and ArfGAP homology domain, a C-terminal glutamine-rich region, and a UBA (ubiquitin associated) domain; gts1 mutations affect budding, cell size, heat tolerance, sporulation, life span, ultradian rhythms, endocytosis; expression oscillates in a pattern similar to metabolic oscillations [Source:SGD;Acc:S000003149]

Location
About this transcript

This transcript has 1 exon, is annotated with 25 domains and features, is associated with 47 variant alleles and maps to 29 oligo probes.

Gene

This transcript is a product of gene YGL181W Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
GTS1YGL181W_mRNA1191396aa
 
Protein coding
P40956 -Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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  • Another exon
Variants
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Other
  • UTR
Markup
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     1 ATGAGGTTTAGGAGTTCTTCCCATAGCTTAAAACATGTTGACAGAGAATTAAAGGAGTTG     60
     1 ATGAGGTTTAGGAGTTCTTCCCATAGCTTAAAACATGTTGACAGAGAATTAAAGGAGTTG     60
     1 -M--R--F--R--S--S--S--H--S--L--K--H--V--D--R--E--L--K--E--L-     20

                                                                          
    61 ATTAATTCGTCCGAGAATGCCAATAAATGCGGTGAATGTGGTAATTTCTACCCAACTTGG    120
    61 ATTAATTCGTCCGAGAATGCCAATAAATGCGGTGAATGTGGTAATTTCTACCCAACTTGG    120
    21 -I--N--S--S--E--N--A--N--K--C--G--E--C--G--N--F--Y--P--T--W-     40

                                                                          
   121 TGCTCAGTTAATTTGGGGGTTTTCCTTTGTGGTAGGTGTGCCTCTGTTCATAGAAAAGTT    180
   121 TGCTCAGTTAATTTGGGGGTTTTCCTTTGTGGTAGGTGTGCCTCTGTTCATAGAAAAGTT    180
    41 -C--S--V--N--L--G--V--F--L--C--G--R--C--A--S--V--H--R--K--V-     60

                                                                          
   181 TTCGGTAGCAGAGACGACGATGCCTTTTCTAACGTTAAATCACTATCAATGGATAGATGG    240
   181 TTCGGTAGCAGAGACGACGATGCCTTTTCTAACGTTAAATCACTATCAATGGATAGATGG    240
    61 -F--G--S--R--D--D--D--A--F--S--N--V--K--S--L--S--M--D--R--W-     80

                                                                          
   241 ACAAGAGAGGATATCGATGAATTAGTGAGTCTTGGAGGCAATAAGGGGAATGCTCGGTTC    300
   241 ACAAGAGAGGATATCGATGAATTAGTGAGTCTTGGAGGCAATAAGGGGAATGCTCGGTTC    300
    81 -T--R--E--D--I--D--E--L--V--S--L--G--G--N--K--G--N--A--R--F-    100

                                                                          
   301 TGGAATCCTAAAAATGTCCCTTTTCCTTTTGATGGAGATGATGACAAAGCCATCGTGGAG    360
   301 TGGAATCCTAAAAATGTCCCTTTTCCTTTTGATGGAGATGATGACAAAGCCATCGTGGAG    360
   101 -W--N--P--K--N--V--P--F--P--F--D--G--D--D--D--K--A--I--V--E-    120

                                                                          
   361 CATTACATTAGAGACAAGTATATTTTGGGTAAATTCAGGTATGATGAAATAAAGCCTGAA    420
   361 CATTACATTAGAGACAAGTATATTTTGGGTAAATTCAGGTATGATGAAATAAAGCCTGAA    420
   121 -H--Y--I--R--D--K--Y--I--L--G--K--F--R--Y--D--E--I--K--P--E-    140

                                                                          
   421 GACTTTGGATCCAGAATGGATGATTTTGATGGGGAATCGGACAGGTTTGATGAAAGAAAT    480
   421 GACTTTGGATCCAGAATGGATGATTTTGATGGGGAATCGGACAGGTTTGATGAAAGAAAT    480
   141 -D--F--G--S--R--M--D--D--F--D--G--E--S--D--R--F--D--E--R--N-    160

                                                                          
   481 AGAAGTAGGAGCAGGAGCAGATCTCATTCTTTCTATAAAGGGGGCCATAATAGGTCTGAC    540
   481 AGAAGTAGGAGCAGGAGCAGATCTCATTCTTTCTATAAAGGGGGCCATAATAGGTCTGAC    540
   161 -R--S--R--S--R--S--R--S--H--S--F--Y--K--G--G--H--N--R--S--D-    180

                                                                          
   541 TACGGCGGTTCCAGGGACTCATTCCAAAGCAGTGGAAGCAGATATTCTAGGCAACTGGCA    600
   541 TACGGCGGTTCCAGGGACTCATTCCAAAGCAGTGGAAGCAGATATTCTAGGCAACTGGCA    600
   181 -Y--G--G--S--R--D--S--F--Q--S--S--G--S--R--Y--S--R--Q--L--A-    200

                                                                          
   601 GAACTCAAGGACATGGGTTTCGGTGATACAAACAAAAATTTAGATGCATTATCGTCCGCT    660
   601 GAACTCAAGGACATGGGTTTCGGTGATACAAACAAAAATTTAGATGCATTATCGTCCGCT    660
   201 -E--L--K--D--M--G--F--G--D--T--N--K--N--L--D--A--L--S--S--A-    220

                                                                          
   661 CACGGAAATATCAATAGAGCAATCGATTATCTAGAAAAAAGTTCAAGTTCAAGAAATAGT    720
   661 CACGGAAATATCAATAGAGCAATCGATTATCTAGAAAAAAGTTCAAGTTCAAGAAATAGT    720
   221 -H--G--N--I--N--R--A--I--D--Y--L--E--K--S--S--S--S--R--N--S-    240

                                                                          
   721 GTATCGGCAGCAGCGACAACATCAACTCCGCCCCTGCCCAGGAGACGTGCGACAACAAGT    780
   721 GTATCGGCAGCAGCGACAACATCAACTCCGCCCCTGCCCAGGAGACGTGCGACAACAAGT    780
   241 -V--S--A--A--A--T--T--S--T--P--P--L--P--R--R--R--A--T--T--S-    260

                                                                          
   781 GGCCCACAGCCAGCTATTTTTGATGGTACAAATGTAATCACGCCAGATTTTACTTCAAAT    840
   781 GGCCCACAGCCAGCTATTTTTGATGGTACAAATGTAATCACGCCAGATTTTACTTCAAAT    840
   261 -G--P--Q--P--A--I--F--D--G--T--N--V--I--T--P--D--F--T--S--N-    280

                                                                          
   841 TCAGCATCTTTTGTACAAGCAAAGCCAGCAGTTTTCGATGGTACCCTTCAACAGTATTAC    900
   841 TCAGCATCTTTTGTACAAGCAAAGCCAGCAGTTTTCGATGGTACCCTTCAACAGTATTAC    900
   281 -S--A--S--F--V--Q--A--K--P--A--V--F--D--G--T--L--Q--Q--Y--Y-    300

                                                                          
   901 GATCCTGCTACCGGAATGATATATGTAGATCAGCAGCAATACGCCATGGCTATGCAACAG    960
   901 GATCCTGCTACCGGAATGATATATGTAGATCAGCAGCAATACGCCATGGCTATGCAACAG    960
   301 -D--P--A--T--G--M--I--Y--V--D--Q--Q--Q--Y--A--M--A--M--Q--Q-    320

                                                                          
   961 CAGCAACAGCAACAGCAACAGCTTGCTGTCGCACAGGCTCAGGCTCAGGCACAGGCACAG   1020
   961 CAGCAACAGCAACAGCAACAGCTTGCTGTCGCACAGGCTCAGGCTCAGGCACAGGCACAG   1020
   321 -Q--Q--Q--Q--Q--Q--Q--L--A--V--A--Q--A--Q--A--Q--A--Q--A--Q-    340

                                                                          
  1021 GCACAGGCTCAAGTTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGGCCCAGGCTCAGGCTCAAGCACAG   1080
  1021 GCACAGGCTCAAGTTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGGCCCAGGCTCAGGCTCAAGCACAG   1080
   341 -A--Q--A--Q--V--Q--A--Q--A--Q--A--Q--A--Q--A--Q--A--Q--A--Q-    360

                                                                          
  1081 CAGATCCAGATGCAACAGCTTCAGATGCAGCAACAGCAACAGGCGCCATTATCTTTTCAG   1140
  1081 CAGATCCAGATGCAACAGCTTCAGATGCAGCAACAGCAACAGGCGCCATTATCTTTTCAG   1140
   361 -Q--I--Q--M--Q--Q--L--Q--M--Q--Q--Q--Q--Q--A--P--L--S--F--Q-    380

                                                                          
  1141 CAAATGTCGCAAGGAGGAAACCTGCCACAAGGTTATTTCTACACACAATAA            1191
  1141 CAAATGTCGCAAGGAGGAAACCTGCCACAAGGTTATTTCTACACACAATAA            1191
   381 -Q--M--S--Q--G--G--N--L--P--Q--G--Y--F--Y--T--Q--*-             396