Sporisorium reilianum (GCA_000230245.1)
Description

probable Hda2-Histone deacetylase

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About this transcript

This transcript has 1 exon and is annotated with 26 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene sr10504 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
sr10504-1CBQ707641758585aa
 
Protein coding
E6ZU57 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Other
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Markup
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     1 ATGGAGCCGGCTCCCGTCTTTCGCACACCTCGCAAGAGGGTAGCGTACTACTACGACCAT     60
     1 ATGGAGCCGGCTCCCGTCTTTCGCACACCTCGCAAGAGGGTAGCGTACTACTACGACCAT     60
     1 -M--E--P--A--P--V--F--R--T--P--R--K--R--V--A--Y--Y--Y--D--H-     20

                                                                          
    61 GACGTCGGCAACTTCAGCTACGGCCTCGGTCACCCCATGAAGCCGCACCGCATGCGCATG    120
    61 GACGTCGGCAACTTCAGCTACGGCCTCGGTCACCCCATGAAGCCGCACCGCATGCGCATG    120
    21 -D--V--G--N--F--S--Y--G--L--G--H--P--M--K--P--H--R--M--R--M-     40

                                                                          
   121 ACGCACAACCTCGTCACCAACTACGGCCTGCACAAGAAGATGGACATCCTCCGTCCCAAG    180
   121 ACGCACAACCTCGTCACCAACTACGGCCTGCACAAGAAGATGGACATCCTCCGTCCCAAG    180
    41 -T--H--N--L--V--T--N--Y--G--L--H--K--K--M--D--I--L--R--P--K-     60

                                                                          
   181 CGTGCCACCCGCGACCAGATGACCCGCTTCCACACCGACGAGTACGTCGACTTTCTCCAC    240
   181 CGTGCCACCCGCGACCAGATGACCCGCTTCCACACCGACGAGTACGTCGACTTTCTCCAC    240
    61 -R--A--T--R--D--Q--M--T--R--F--H--T--D--E--Y--V--D--F--L--H-     80

                                                                          
   241 CGCGTCACCCCCGAATCCGTCCACGAGCTCACCAACGAAGGCACGCGCTACCTCATCGGC    300
   241 CGCGTCACCCCCGAATCCGTCCACGAGCTCACCAACGAAGGCACGCGCTACCTCATCGGC    300
    81 -R--V--T--P--E--S--V--H--E--L--T--N--E--G--T--R--Y--L--I--G-    100

                                                                          
   301 GAGGACTGCCCCGCCTTTGACGGCCTCTACGAGTTCTGCTCCATCTCAGCCGGTGGCTCG    360
   301 GAGGACTGCCCCGCCTTTGACGGCCTCTACGAGTTCTGCTCCATCTCAGCCGGTGGCTCG    360
   101 -E--D--C--P--A--F--D--G--L--Y--E--F--C--S--I--S--A--G--G--S-    120

                                                                          
   361 CTCGCGGCTGCTTCGCGTCTCAACTCGGGCGAGTCGGACGTCGCCATCAACTGGGCCGGT    420
   361 CTCGCGGCTGCTTCGCGTCTCAACTCGGGCGAGTCGGACGTCGCCATCAACTGGGCCGGT    420
   121 -L--A--A--A--S--R--L--N--S--G--E--S--D--V--A--I--N--W--A--G-    140

                                                                          
   421 GGTCTGCATCACGCCAAGAAGAGAGAGGCGAGTGGCTTCTGCTACGTCAACGACATCGTG    480
   421 GGTCTGCATCACGCCAAGAAGAGAGAGGCGAGTGGCTTCTGCTACGTCAACGACATCGTG    480
   141 -G--L--H--H--A--K--K--R--E--A--S--G--F--C--Y--V--N--D--I--V-    160

                                                                          
   481 CTCGCCATCCTCGAGCTGCTGCGTGTCCACCTCCGCGTGCTCTACATCGACATTGACATC    540
   481 CTCGCCATCCTCGAGCTGCTGCGTGTCCACCTCCGCGTGCTCTACATCGACATTGACATC    540
   161 -L--A--I--L--E--L--L--R--V--H--L--R--V--L--Y--I--D--I--D--I-    180

                                                                          
   541 CACCACGGCGACGGTGTCGAGGAAGCGTTCTACACCACCGACCGCGTCATGACCGCCAGC    600
   541 CACCACGGCGACGGTGTCGAGGAAGCGTTCTACACCACCGACCGCGTCATGACCGCCAGC    600
   181 -H--H--G--D--G--V--E--E--A--F--Y--T--T--D--R--V--M--T--A--S-    200

                                                                          
   601 TTCCACAAGTTTGGCGACTTCTTCCCCGGCACCGGCGACGTGCGCGACATCGGCCTCAAG    660
   601 TTCCACAAGTTTGGCGACTTCTTCCCCGGCACCGGCGACGTGCGCGACATCGGCCTCAAG    660
   201 -F--H--K--F--G--D--F--F--P--G--T--G--D--V--R--D--I--G--L--K-    220

                                                                          
   661 AAGGGCAAGAACTACTGCGTCAACGTGCCCCTCCGCGACGGCATCGGCGATCTCGAGTTT    720
   661 AAGGGCAAGAACTACTGCGTCAACGTGCCCCTCCGCGACGGCATCGGCGATCTCGAGTTT    720
   221 -K--G--K--N--Y--C--V--N--V--P--L--R--D--G--I--G--D--L--E--F-    240

                                                                          
   721 GGCAACATCTTCCGTCCCGTCATCTCGCACATCATGGAATGGTACCGACCCGGTGCCGTG    780
   721 GGCAACATCTTCCGTCCCGTCATCTCGCACATCATGGAATGGTACCGACCCGGTGCCGTG    780
   241 -G--N--I--F--R--P--V--I--S--H--I--M--E--W--Y--R--P--G--A--V-    260

                                                                          
   781 GTGCTGCAGTGCGGTGCCGACTCGCTCGCTGGCGACAAGCTGGGCTGCTTCAACCTCTCG    840
   781 GTGCTGCAGTGCGGTGCCGACTCGCTCGCTGGCGACAAGCTGGGCTGCTTCAACCTCTCG    840
   261 -V--L--Q--C--G--A--D--S--L--A--G--D--K--L--G--C--F--N--L--S-    280

                                                                          
   841 ATGCGCGGCCACGCCCAGTGCGTCGCCTTCATGCAGACCTTCGACGTGCCGCTCATCACG    900
   841 ATGCGCGGCCACGCCCAGTGCGTCGCCTTCATGCAGACCTTCGACGTGCCGCTCATCACG    900
   281 -M--R--G--H--A--Q--C--V--A--F--M--Q--T--F--D--V--P--L--I--T-    300

                                                                          
   901 CTCGGCGGAGGCGGATACACCGTGCGCAACGTCGCGCGCACATGGACGTACGAGACGGGC    960
   901 CTCGGCGGAGGCGGATACACCGTGCGCAACGTCGCGCGCACATGGACGTACGAGACGGGC    960
   301 -L--G--G--G--G--Y--T--V--R--N--V--A--R--T--W--T--Y--E--T--G-    320

                                                                          
   961 CTGCTCGTGGGTCAGAAGCTCGACGAGGACCTGCCCTTCAACGACTACATCCAGTACTTT   1020
   961 CTGCTCGTGGGTCAGAAGCTCGACGAGGACCTGCCCTTCAACGACTACATCCAGTACTTT   1020
   321 -L--L--V--G--Q--K--L--D--E--D--L--P--F--N--D--Y--I--Q--Y--F-    340

                                                                          
  1021 GGCCCCGAGTACAAGCTCGACGTGCCGCCCACGTCGATGGACAACCTCAACTCGCGCGAG   1080
  1021 GGCCCCGAGTACAAGCTCGACGTGCCGCCCACGTCGATGGACAACCTCAACTCGCGCGAG   1080
   341 -G--P--E--Y--K--L--D--V--P--P--T--S--M--D--N--L--N--S--R--E-    360

                                                                          
  1081 TACCTCGACAACCTGCGCACCAAGATCATCGGCAACCTGCGCAACCTGCCCTCGGCCCCC   1140
  1081 TACCTCGACAACCTGCGCACCAAGATCATCGGCAACCTGCGCAACCTGCCCTCGGCCCCC   1140
   361 -Y--L--D--N--L--R--T--K--I--I--G--N--L--R--N--L--P--S--A--P-    380

                                                                          
  1141 GGTGTGCAGATGCAAGACACGCCGCGCACCACGCTCAACCCGGCCGACGTCGAGGTGTCG   1200
  1141 GGTGTGCAGATGCAAGACACGCCGCGCACCACGCTCAACCCGGCCGACGTCGAGGTGTCG   1200
   381 -G--V--Q--M--Q--D--T--P--R--T--T--L--N--P--A--D--V--E--V--S-    400

                                                                          
  1201 GACGACGAGGATTCCGATCTGGACGAGCGCATCTCGCAGCGCTTGCGCGATGCGCACGTG   1260
  1201 GACGACGAGGATTCCGATCTGGACGAGCGCATCTCGCAGCGCTTGCGCGATGCGCACGTG   1260
   401 -D--D--E--D--S--D--L--D--E--R--I--S--Q--R--L--R--D--A--H--V-    420

                                                                          
  1261 CAGCGATGGGACGACGAGCTGTCCGGCGACGAGGCCGACGCGGATGGCGACGCACTGGCA   1320
  1261 CAGCGATGGGACGACGAGCTGTCCGGCGACGAGGCCGACGCGGATGGCGACGCACTGGCA   1320
   421 -Q--R--W--D--D--E--L--S--G--D--E--A--D--A--D--G--D--A--L--A-    440

                                                                          
  1321 TCGGAGTGGGCTGCGGCAACGAGCAGGAGGTCGAGCAGTGCATCCACGAGCAAGAGGAGG   1380
  1321 TCGGAGTGGGCTGCGGCAACGAGCAGGAGGTCGAGCAGTGCATCCACGAGCAAGAGGAGG   1380
   441 -S--E--W--A--A--A--T--S--R--R--S--S--S--A--S--T--S--K--R--R-    460

                                                                          
  1381 CCGGGCATCATGGACCCGCTCAAGCCGTTCGAGCACGATCTGGGGCTCAAGTACATCTCG   1440
  1381 CCGGGCATCATGGACCCGCTCAAGCCGTTCGAGCACGATCTGGGGCTCAAGTACATCTCG   1440
   461 -P--G--I--M--D--P--L--K--P--F--E--H--D--L--G--L--K--Y--I--S-    480

                                                                          
  1441 CAGAACGGCGCCGGAGCAGCCAAGGGCAAAGGTCGCGCTAAGCGGACCTTCTTCGCCGCG   1500
  1441 CAGAACGGCGCCGGAGCAGCCAAGGGCAAAGGTCGCGCTAAGCGGACCTTCTTCGCCGCG   1500
   481 -Q--N--G--A--G--A--A--K--G--K--G--R--A--K--R--T--F--F--A--A-    500

                                                                          
  1501 CGCGCCGCCAAGCCGGTGCTCGTCGACCTGCATCTGGACGAAGACGACGACCACGACGAC   1560
  1501 CGCGCCGCCAAGCCGGTGCTCGTCGACCTGCATCTGGACGAAGACGACGACCACGACGAC   1560
   501 -R--A--A--K--P--V--L--V--D--L--H--L--D--E--D--D--D--H--D--D-    520

                                                                          
  1561 CACGAGCACCGTCACCAGCTCAACGGCAGGATAGGCGCGAGGAGCGCACGCACCCGCGCG   1620
  1561 CACGAGCACCGTCACCAGCTCAACGGCAGGATAGGCGCGAGGAGCGCACGCACCCGCGCG   1620
   521 -H--E--H--R--H--Q--L--N--G--R--I--G--A--R--S--A--R--T--R--A-    540

                                                                          
  1621 TTCTTTGCCACCGACGCCTCGGCGCGTGCACCGGGCGACGCTACGCCGCTGAGCGACGTC   1680
  1621 TTCTTTGCCACCGACGCCTCGGCGCGTGCACCGGGCGACGCTACGCCGCTGAGCGACGTC   1680
   541 -F--F--A--T--D--A--S--A--R--A--P--G--D--A--T--P--L--S--D--V-    560

                                                                          
  1681 GAGATGGGCTCGCCTGCGCTGTCGGCTGCTGCGGTCGCGTCGACCAACGGTCATGCGAGG   1740
  1681 GAGATGGGCTCGCCTGCGCTGTCGGCTGCTGCGGTCGCGTCGACCAACGGTCATGCGAGG   1740
   561 -E--M--G--S--P--A--L--S--A--A--A--V--A--S--T--N--G--H--A--R-    580

                                                                          
  1741 GCCAACGGTCGCAGGTGA                                             1758
  1741 GCCAACGGTCGCAGGTGA                                             1758
   581 -A--N--G--R--R--*-                                              585