Schizosaccharomyces pombe (ASM294v2)
Description

COP9/signalosome complex subunit Csn5 [Source:PomBase;Acc:SPAC1687.13c]

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About this transcript

This transcript has 3 exons, is annotated with 8 domains and features and is associated with 20 variant alleles.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
csn5SPAC1687.13c.11107299aa
 
Protein coding
O94454 -Ensembl Canonical
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     1 GCGAGTTTTACTTGTACTCGAAAAGTTCTCCAACATTTTTTCGTCACATACCACAAATGA     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 TTCATTTTCTGTATTTAATGACTACAATTACAAAATTGCAATGAATAATCAACTCGAAAA    120
       ........................................ATGAATAATCAACTCGAAAA     20
       ........................................-M--N--N--Q--L--E--N      7

                                                                          
   121 TGTTTTTAGATTTGATGAAGAAAAAGAGAGGGCTAAAATTCGTGAATCGCCGTGGAAACA    180
    21 TGTTTTTAGATTTGATGAAGAAAAAGAGAGGGCTAAAATTCGTGAATCGCCGTGGAAACA     80
     7 --V--F--R--F--D--E--E--K--E--R--A--K--I--R--E--S--P--W--K--H     27

                                                                          
   181 TGACCCAGAGTTTTTCCGTTCTGTCAAAATCTCAGCAGTAGCTTTGTTGAAAATGTTACG    240
    81 TGACCCAGAGTTTTTCCGTTCTGTCAAAATCTCAGCAGTAGCTTTGTTGAAAATGTTACG    140
    27 --D--P--E--F--F--R--S--V--K--I--S--A--V--A--L--L--K--M--L--R     47

                                                                          
   241 GCATGTATCTCAAGGCATGCCATTAGAGGTAATGGGCTATGTTCAGGGGAAGGTTGAAGG    300
   141 GCATGTATCTCAAGGCATGCCATTAGAGGTAATGGGCTATGTTCAGGGGAAGGTTGAAGG    200
    47 --H--V--S--Q--G--M--P--L--E--V--M--G--Y--V--Q--G--K--V--E--G     67

                                                                          
   301 GGCCTCCTTGATTATTTTAGATTCTTTTGCGTTACCAGTTGAAGGTACTGAGACTCGTGT    360
   201 GGCCTCCTTGATTATTTTAGATTCTTTTGCGTTACCAGTTGAAGGTACTGAGACTCGTGT    260
    67 --A--S--L--I--I--L--D--S--F--A--L--P--V--E--G--T--E--T--R--V     87

                                                                          
   361 CAATGCACATGAAGAAGCACAAGAATACAGTGTACAATATCATACTCTTTGCAAGTCTGT    420
   261 CAATGCACATGAAGAAGCACAAGAATACAGTGTACAATATCATACTCTTTGCAAGTCTGT    320
    87 --N--A--H--E--E--A--Q--E--Y--S--V--Q--Y--H--T--L--C--K--S--V    107

                                                                          
   421 TTACAGACATGAAAATGTCATAGGATGGTACCATTCACATCCTAACTATGGTTGCTGGCT    480
   321 TTACAGACATGAAAATGTCATAGGATGGTACCATTCACATCCTAACTATGGTTGCTGGCT    380
   107 --Y--R--H--E--N--V--I--G--W--Y--H--S--H--P--N--Y--G--C--W--L    127

                                                                          
   481 TTCAGGTGTAGATGTTGAAACTCAGCGCCAAAATCAAAAATATCAGGATCCATTTGTTGC    540
   381 TTCAGGTGTAGATGTTGAAACTCAGCGCCAAAATCAAAAATATCAGGATCCATTTGTTGC    440
   127 --S--G--V--D--V--E--T--Q--R--Q--N--Q--K--Y--Q--D--P--F--V--A    147

                                                                          
   541 CGTTGTGTTGGACCCGAAGCGATCCTTGGAATCTCCATATGTAAACATTGGAGCATTTCG    600
   441 CGTTGTGTTGGACCCGAAGCGATCCTTGGAATCTCCATATGTAAACATTGGAGCATTTCG    500
   147 --V--V--L--D--P--K--R--S--L--E--S--P--Y--V--N--I--G--A--F--R    167

                                                                          
   601 AACCTATCCTGTCGGTAATGATGGCTCTATCCGCACAAAATCTCGTCATCACCCGTCTGT    660
   501 AACCTATCCTGTCGGTAATGATGGCTCTATCCGCACAAAATCTCGTCATCACCCGTCTGT    560
   167 --T--Y--P--V--G--N--D--G--S--I--R--T--K--S--R--H--H--P--S--V    187

                                                                          
   661 CTTATTTAAAAATTTACCTTCTTCCAAAATCGAAGATGCCGGAGCCCACGCAGAAGCGTA    720
   561 CTTATTTAAAAATTTACCTTCTTCCAAAATCGAAGATGCCGGAGCCCACGCAGAAGCGTA    620
   187 --L--F--K--N--L--P--S--S--K--I--E--D--A--G--A--H--A--E--A--Y    207

                                                                          
   721 CTACAGTCTCCCTATAACTTACTTTCATTCCAAAGCTGAAAAAAAGGTTACGGAGTTTTT    780
   621 CTACAGTCTCCCTATAACTTACTTTCATTCCAAAGCTGAAAAAAAGGTTACGGAGTTTTT    680
   207 --Y--S--L--P--I--T--Y--F--H--S--K--A--E--K--K--V--T--E--F--L    227

                                                                          
   781 AAGGAATAGAAACTGGTCTAGGTCAATCACCGAGTGTTCTATTTTACAAAACAATGAATT    840
   681 AAGGAATAGAAACTGGTCTAGGTCAATCACCGAGTGTTCTATTTTACAAAACAATGAATT    740
   227 --R--N--R--N--W--S--R--S--I--T--E--C--S--I--L--Q--N--N--E--F    247

                                                                          
   841 TTTACATGACAGCGAAAAATTAATCGATCATCTTATTCATGAAACAGGGAATAATGAATT    900
   741 TTTACATGACAGCGAAAAATTAATCGATCATCTTATTCATGAAACAGGGAATAATGAATT    800
   247 --L--H--D--S--E--K--L--I--D--H--L--I--H--E--T--G--N--N--E--L    267

                                                                          
   901 ACCTGTTGCATCTGCCTACGAACAATCCAAAGCTTGTTGTAACGAATTATCTACTTTTCT    960
   801 ACCTGTTGCATCTGCCTACGAACAATCCAAAGCTTGTTGTAACGAATTATCTACTTTTCT    860
   267 --P--V--A--S--A--Y--E--Q--S--K--A--C--C--N--E--L--S--T--F--L    287

                                                                          
   961 GTCTCAAATTGATGTCCAAGATAAATTATTTAAAGAATGAATAAATCAACGATTCACTAA   1020
   861 GTCTCAAATTGATGTCCAAGATAAATTATTTAAAGAATGA....................    900
   287 --S--Q--I--D--V--Q--D--K--L--F--K--E--*-....................    299

                                                                          
  1021 TATCAGGAAACATGAGATATATAAACGTCGAATCTACTAAGTAATACAGTACAGTTTATT   1080
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1081 AATGAAAGTCATATTAATATATTTCAG                                    1107
       ...........................                                        
       ...........................