Schizosaccharomyces japonicus (GCA_000149845.2)
Description

Smc5-6 complex non-SMC subunit 1

About this transcript

This transcript has 2 exons and is annotated with 6 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene SJAG_05323 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
SJAG_05323-1EEB08948889224aa
 
Protein coding
B6K5Z4 -Ensembl Canonical
Codons
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     1 AGACGCGTCAAACTACATGCTTCCTACACGACACAAGGTTACTCTGCAACACATCATTTC     60
       ................ATGCTTCCTACACGACACAAGGTTACTCTGCAACACATCATTTC     44
       ................-M--L--P--T--R--H--K--V--T--L--Q--H--I--I--S     15

                                                                          
    61 TCGGTCGGCTGGAATTGAAGAAGCAGAACTTGAGCAATTCATACATCGCCAGAATGAAGA    120
    45 TCGGTCGGCTGGAATTGAAGAAGCAGAACTTGAGCAATTCATACATCGCCAGAATGAAGA    104
    15 --R--S--A--G--I--E--E--A--E--L--E--Q--F--I--H--R--Q--N--E--D     35

                                                                          
   121 TGACCGGTTCAATGATGTTATAGACGACATCAATCGTGCTTTGCACGATTTAGATTTTCA    180
   105 TGACCGGTTCAATGATGTTATAGACGACATCAATCGTGCTTTGCACGATTTAGATTTTCA    164
    35 --D--R--F--N--D--V--I--D--D--I--N--R--A--L--H--D--L--D--F--Q     55

                                                                          
   181 GCTGAAACGCGTTCTGGATCAAATTGATGGACGCGTATTTTGGTATCTTCAAAACATGTC    240
   165 GCTGAAACGCGTTCTGGATCAAATTGATGGACGCGTATTTTGGTATCTTCAAAACATGTC    224
    55 --L--K--R--V--L--D--Q--I--D--G--R--V--F--W--Y--L--Q--N--M--S     75

                                                                          
   241 GAGCGACACAGTATCGCAACAGGCAACATTCTATCCCAGCATCGAGGTCGAGTTCTTCCG    300
   225 GAGCGACACAGTATCGCAACAGGCAACATTCTATCCCAGCATCGAGGTCGAGTTCTTCCG    284
    75 --S--D--T--V--S--Q--Q--A--T--F--Y--P--S--I--E--V--E--F--F--R     95

                                                                          
   301 TTACCTGATTGAGTGGATCATACAGGCGGAAAACTACGCGTTTTCTCTTTCTTCACTTGA    360
   285 TTACCTGATTGAGTGGATCATACAGGCGGAAAACTACGCGTTTTCTCTTTCTTCACTTGA    344
    95 --Y--L--I--E--W--I--I--Q--A--E--N--Y--A--F--S--L--S--S--L--D    115

                                                                          
   361 TATCCACAGACTTGCAGCAAAAGAGGAAAAACTCCCGCTAGCAACACACACAGTTGAATC    420
   345 TATCCACAGACTTGCAGCAAAAGAGGAAAAACTCCCGCTAGCAACACACACAGTTGAATC    404
   115 --I--H--R--L--A--A--K--E--E--K--L--P--L--A--T--H--T--V--E--S    135

                                                                          
   421 CTACTTGCAGGATTTTGAACGAGACGAATGGCTCGTCCAACGCGACGGCATGTACTCATT    480
   405 CTACTTGCAGGATTTTGAACGAGACGAATGGCTCGTCCAACGCGACGGCATGTACTCATT    464
   135 --Y--L--Q--D--F--E--R--D--E--W--L--V--Q--R--D--G--M--Y--S--L    155

                                                                          
   481 ATCCAATCGGTCACTGGCTGACTTGGAGCAGTACCTGCGAACAGAGTACGAAAACAGTGT    540
   465 ATCCAATCGGTCACTGGCTGACTTGGAGCAGTACCTGCGAACAGAGTACGAAAACAGTGT    524
   155 --S--N--R--S--L--A--D--L--E--Q--Y--L--R--T--E--Y--E--N--S--V    175

                                                                          
   541 TTTTGAATGCAATGCATGTCGCGGAATCGTCACTCTGGGCGGTTTATGCAATTGCGGTTA    600
   525 TTTTGAATGCAATGCATGTCGCGGAATCGTCACTCTGGGCGGTTTATGCAATTGCGGTTA    584
   175 --F--E--C--N--A--C--R--G--I--V--T--L--G--G--L--C--N--C--G--Y    195

                                                                          
   601 CTGCTTGCATGTTTACTGCTGCAATCGATTACAGTCCGTCCAATGTCCCAGCTGTAACGA    660
   585 CTGCTTGCATGTTTACTGCTGCAATCGATTACAGTCCGTCCAATGTCCCAGCTGTAACGA    644
   195 --C--L--H--V--Y--C--C--N--R--L--Q--S--V--Q--C--P--S--C--N--E    215

                                                                          
   661 ACCTTGGGACAATGTTACTAAGCTTGGCTAAGGCAGCTATGAAAATGGCCGCGGTTTTTC    720
   645 ACCTTGGGACAATGTTACTAAGCTTGGCTAA.............................    675
   215 --P--W--D--N--V--T--K--L--G--*-.............................    224

                                                                          
   721 CACGGTCCGTAAAAATCTGTTCCATTCCGGTATCCAGGATATCGTATTCCAGTGCACAAT    780
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   781 GTTGTATCGATGACATCCAACAGAATGACCGTGAAACTTATAAACCACATTGTCCGCGGG    840
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   841 TTCGGCAGAACGAACCTCTCAATATGCCAAAAAGATTGTTTCGATTCCT               889
       .................................................                  
       .................................................