Schizosaccharomyces japonicus (GCA_000149845.2) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID History.
coatomer beta' subunit
SuperContig supercont5.2: 3,152,430-3,155,575 reverse strand.
This transcript has 2 exons and is annotated with 34 domains and features.
This transcript is a product of gene SJAG_04070 Show transcript tableHide transcript table
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1 CCTACCTACCTAAGCCAACAGCACCCTACCAACTGCCTCTACCCTCGTTTCCCTTCATTC 60 ............................................................ ............................................................ 61 CGTAGAGTTTCTAATAGTCCTTTGAGGTTTTGGAGCCGTTGTAGACCTCCTTATAATAAT 120 ..........................................................AT 2 ..........................................................-M 1 121 GCGTTTGGACTTTAAGAGGAAGTTTTTGACGCACACAGATCGCGTTAAAGCAATCGATTT 180 3 GCGTTTGGACTTTAAGAGGAAGTTTTTGACGCACACAGATCGCGTTAAAGCAATCGATTT 62 1 --R--L--D--F--K--R--K--F--L--T--H--T--D--R--V--K--A--I--D--F 21 181 CCATCCTTCCGAGCCATGGATTCTCTCTTCTCACTATAACGGTGAAGTCTGCATCTGGAA 240 63 CCATCCTTCCGAGCCATGGATTCTCTCTTCTCACTATAACGGTGAAGTCTGCATCTGGAA 122 21 --H--P--S--E--P--W--I--L--S--S--H--Y--N--G--E--V--C--I--W--N 41 241 TTATGAAACTCAGACGCCAGTAAAGAAATTCGACATCAACGATGTCCCTATCCGGGCTTG 300 123 TTATGAAACTCAGACGCCAGTAAAGAAATTCGACATCAACGATGTCCCTATCCGGGCTTG 182 41 --Y--E--T--Q--T--P--V--K--K--F--D--I--N--D--V--P--I--R--A--C 61 301 TGCTTTTATCGCTCGTAAAAACTGGTTCGTCTGCGGAAGCGATGACTTCCAACTGCGTGT 360 183 TGCTTTTATCGCTCGTAAAAACTGGTTCGTCTGCGGAAGCGATGACTTCCAACTGCGTGT 242 61 --A--F--I--A--R--K--N--W--F--V--C--G--S--D--D--F--Q--L--R--V 81 361 GTACAATTACAACACTGGTGAAAAGGTTACACAGTTTGAGGCACACCCTGATTACATTCG 420 243 GTACAATTACAACACTGGTGAAAAGGTTACACAGTTTGAGGCACACCCTGATTACATTCG 302 81 --Y--N--Y--N--T--G--E--K--V--T--Q--F--E--A--H--P--D--Y--I--R 101 421 GGCACTTACTGTTCATCCCACACAACCATTTGTTTTGACTTGTTCTGACGACACAAAAAT 480 303 GGCACTTACTGTTCATCCCACACAACCATTTGTTTTGACTTGTTCTGACGACACAAAAAT 362 101 --A--L--T--V--H--P--T--Q--P--F--V--L--T--C--S--D--D--T--K--I 121 481 CAAATGCTGGAACTGGGAGCAGAACTGGAAGTGTGTCCAGGTGTTTGAGGGTCATTCTCG 540 363 CAAATGCTGGAACTGGGAGCAGAACTGGAAGTGTGTCCAGGTGTTTGAGGGTCATTCTCG 422 121 --K--C--W--N--W--E--Q--N--W--K--C--V--Q--V--F--E--G--H--S--R 141 541 CTATGTCATGAGTTTGGCAATTAATCCCAAAGACACGAACACATTTGCCTCCTCTTGTTT 600 423 CTATGTCATGAGTTTGGCAATTAATCCCAAAGACACGAACACATTTGCCTCCTCTTGTTT 482 141 --Y--V--M--S--L--A--I--N--P--K--D--T--N--T--F--A--S--S--C--L 161 601 GGACGGAAGCGTCAAGATTTGGAGTTTTGGCTCTACTGTTGCCAACTTTACTCTCGAGGC 660 483 GGACGGAAGCGTCAAGATTTGGAGTTTTGGCTCTACTGTTGCCAACTTTACTCTCGAGGC 542 161 --D--G--S--V--K--I--W--S--F--G--S--T--V--A--N--F--T--L--E--A 181 661 GCACGACAAGGGTGCCAATTTCGTCAGTTACTATCCTGCTGGCGATAAGCCATACCTTGT 720 543 GCACGACAAGGGTGCCAATTTCGTCAGTTACTATCCTGCTGGCGATAAGCCATACCTTGT 602 181 --H--D--K--G--A--N--F--V--S--Y--Y--P--A--G--D--K--P--Y--L--V 201 721 TACAGCCGGTGATGATCGTTTAATTAAGATTTGGGACTATCAAACGAAAGCTTGTGTTCG 780 603 TACAGCCGGTGATGATCGTTTAATTAAGATTTGGGACTATCAAACGAAAGCTTGTGTTCG 662 201 --T--A--G--D--D--R--L--I--K--I--W--D--Y--Q--T--K--A--C--V--R 221 781 TGTGTTGGAAGGCCACACGAACAACGTCTCATTTGCTCTCTTTCACAACAAGTTCCCTCT 840 663 TGTGTTGGAAGGCCACACGAACAACGTCTCATTTGCTCTCTTTCACAACAAGTTCCCTCT 722 221 --V--L--E--G--H--T--N--N--V--S--F--A--L--F--H--N--K--F--P--L 241 841 TGCAATTTCTGGTAGCGAAGATGGAACCGTTAAGATTTGGCACACCCTCTCTTATGAGTT 900 723 TGCAATTTCTGGTAGCGAAGATGGAACCGTTAAGATTTGGCACACCCTCTCTTATGAGTT 782 241 --A--I--S--G--S--E--D--G--T--V--K--I--W--H--T--L--S--Y--E--L 261 901 GGTGAAGTCTTATAACTTTTCTATGGAGCGGGCTTGGTGCATATCTCAAAATTCGGAGAA 960 783 GGTGAAGTCTTATAACTTTTCTATGGAGCGGGCTTGGTGCATATCTCAAAATTCGGAGAA 842 261 --V--K--S--Y--N--F--S--M--E--R--A--W--C--I--S--Q--N--S--E--N 281 961 CGGTCTAGTGACAGTGGGTTTTGACAGTGGAATAATCGTTTTCTCCCTGGGACGTGATGA 1020 843 CGGTCTAGTGACAGTGGGTTTTGACAGTGGAATAATCGTTTTCTCCCTGGGACGTGATGA 902 281 --G--L--V--T--V--G--F--D--S--G--I--I--V--F--S--L--G--R--D--E 301 1021 ACCTATTGTAAGCATGGACAACTCGGGCAAAATTGTCTGGTCTACATACTCCGAAATCCA 1080 903 ACCTATTGTAAGCATGGACAACTCGGGCAAAATTGTCTGGTCTACATACTCCGAAATCCA 962 301 --P--I--V--S--M--D--N--S--G--K--I--V--W--S--T--Y--S--E--I--Q 321 1081 ATCCGCCATGATTAAACCCGTTGCGAATGAAGAGGTTACAGATGGTTCGTCCATCAATCT 1140 963 ATCCGCCATGATTAAACCCGTTGCGAATGAAGAGGTTACAGATGGTTCGTCCATCAATCT 1022 321 --S--A--M--I--K--P--V--A--N--E--E--V--T--D--G--S--S--I--N--L 341 1141 GTCCCCCAAGAGTCTTGGCAATTCGGATACCATTCCCGTGAAAATGCAACACTCGCCCAA 1200 1023 GTCCCCCAAGAGTCTTGGCAATTCGGATACCATTCCCGTGAAAATGCAACACTCGCCCAA 1082 341 --S--P--K--S--L--G--N--S--D--T--I--P--V--K--M--Q--H--S--P--N 361 1201 CGGTCGCTTTGTGACCGTATGCGGAAGTGACGAATACATTGTATACACAGCACTGGCATG 1260 1083 CGGTCGCTTTGTGACCGTATGCGGAAGTGACGAATACATTGTATACACAGCACTGGCATG 1142 361 --G--R--F--V--T--V--C--G--S--D--E--Y--I--V--Y--T--A--L--A--W 381 1261 GCGTAGTAAAGTTTACGGAAAGGCTCTTGATTTTGCTTGGTCTAACGACGCTAATGCTTA 1320 1143 GCGTAGTAAAGTTTACGGAAAGGCTCTTGATTTTGCTTGGTCTAACGACGCTAATGCTTA 1202 381 --R--S--K--V--Y--G--K--A--L--D--F--A--W--S--N--D--A--N--A--Y 401 1321 TGCTACAAAAGTCTCGGATAAGATCATCAAGTTCTCTAAGAATTTCAAGGAGCGTCCTGA 1380 1203 TGCTACAAAAGTCTCGGATAAGATCATCAAGTTCTCTAAGAATTTCAAGGAGCGTCCTGA 1262 401 --A--T--K--V--S--D--K--I--I--K--F--S--K--N--F--K--E--R--P--D 421 1381 TGCTTTGGAGCTTGATTATTCATGTGATGCTCTTTTCGGTGGCCATCTTTTGGGTGTATC 1440 1263 TGCTTTGGAGCTTGATTATTCATGTGATGCTCTTTTCGGTGGCCATCTTTTGGGTGTATC 1322 421 --A--L--E--L--D--Y--S--C--D--A--L--F--G--G--H--L--L--G--V--S 441 1441 GGGTGCCGACTTTATCTGTTTTTATGATTGGGAATCCAAGATTTTGGCTCGTAAAATTGA 1500 1323 GGGTGCCGACTTTATCTGTTTTTATGATTGGGAATCCAAGATTTTGGCTCGTAAAATTGA 1382 441 --G--A--D--F--I--C--F--Y--D--W--E--S--K--I--L--A--R--K--I--D 461 1501 CGTGAAGCCCAAAAACGTTTACTGGAGTGAAGATGGTACTCGTGTTGTTCTCTCTTGTTC 1560 1383 CGTGAAGCCCAAAAACGTTTACTGGAGTGAAGATGGTACTCGTGTTGTTCTCTCTTGTTC 1442 461 --V--K--P--K--N--V--Y--W--S--E--D--G--T--R--V--V--L--S--C--S 481 1561 TGATGCATTTTATATTCTTACTTTTAACGCTGACGCCTTTTATGCCGCTGCCGAAGCAAA 1620 1443 TGATGCATTTTATATTCTTACTTTTAACGCTGACGCCTTTTATGCCGCTGCCGAAGCAAA 1502 481 --D--A--F--Y--I--L--T--F--N--A--D--A--F--Y--A--A--A--E--A--N 501 1621 TACTATTGCAGATGATGGCGCAGAAGAAGCTTTTGAACCAGTATTTGAGAGTTCCGATGT 1680 1503 TACTATTGCAGATGATGGCGCAGAAGAAGCTTTTGAACCAGTATTTGAGAGTTCCGATGT 1562 501 --T--I--A--D--D--G--A--E--E--A--F--E--P--V--F--E--S--S--D--V 521 1681 TGTCGTCAGCGGAAAGTGGGTTGGTACTACGTTCATTTACTGCACAGGCTCTGGACGTCT 1740 1563 TGTCGTCAGCGGAAAGTGGGTTGGTACTACGTTCATTTACTGCACAGGCTCTGGACGTCT 1622 521 --V--V--S--G--K--W--V--G--T--T--F--I--Y--C--T--G--S--G--R--L 541 1741 CAACTATCTTGTTGCCGATCAAGTCTTTAAAATCAGCAGCGTTGAGAACTACGTATATCT 1800 1623 CAACTATCTTGTTGCCGATCAAGTCTTTAAAATCAGCAGCGTTGAGAACTACGTATATCT 1682 541 --N--Y--L--V--A--D--Q--V--F--K--I--S--S--V--E--N--Y--V--Y--L 561 1801 TTTAGGATACTTGCCCAGAGATGGACGGATTTATCTTGCTGATCGTGACTTGAATATAAT 1860 1683 TTTAGGATACTTGCCCAGAGATGGACGGATTTATCTTGCTGATCGTGACTTGAATATAAT 1742 561 --L--G--Y--L--P--R--D--G--R--I--Y--L--A--D--R--D--L--N--I--I 581 1861 CAGCTACGCTTTCAATTTGAATGTGGTTGAGTATCAAACCGCTGTTCTTGATGGAAACCT 1920 1743 CAGCTACGCTTTCAATTTGAATGTGGTTGAGTATCAAACCGCTGTTCTTGATGGAAACCT 1802 581 --S--Y--A--F--N--L--N--V--V--E--Y--Q--T--A--V--L--D--G--N--L 601 1921 CGAGGAAGCCAAATCCATTCTCGATAAAATTCCCGAGGATGAAAAAAGCAAGCTTTCTGA 1980 1803 CGAGGAAGCCAAATCCATTCTCGATAAAATTCCCGAGGATGAAAAAAGCAAGCTTTCTGA 1862 601 --E--E--A--K--S--I--L--D--K--I--P--E--D--E--K--S--K--L--S--D 621 1981 TTTTCTTTCTGATCTTGGTTATAAGGAAGCTGCTTTGGACCTGTCTACAGATGATGAGCA 2040 1863 TTTTCTTTCTGATCTTGGTTATAAGGAAGCTGCTTTGGACCTGTCTACAGATGATGAGCA 1922 621 --F--L--S--D--L--G--Y--K--E--A--A--L--D--L--S--T--D--D--E--Q 641 2041 ACGCTTTGAACTTGCGTTAGAAGCCGGCCAACTGGAAACCGCGGCTGTTCTTGCTCGCTC 2100 1923 ACGCTTTGAACTTGCGTTAGAAGCCGGCCAACTGGAAACCGCGGCTGTTCTTGCTCGCTC 1982 641 --R--F--E--L--A--L--E--A--G--Q--L--E--T--A--A--V--L--A--R--S 661 2101 ATTGGACGATGTTTCAAAATGGAGACAGCTTGGTGATGTGGCCCTCAATAACTGGGACTT 2160 1983 ATTGGACGATGTTTCAAAATGGAGACAGCTTGGTGATGTGGCCCTCAATAACTGGGACTT 2042 661 --L--D--D--V--S--K--W--R--Q--L--G--D--V--A--L--N--N--W--D--F 681 2161 TGTTTTGGCTGAGGAATGTTTTACAAAAGCTCAAGATCACAGTTCTTTGTTGCTCTTATA 2220 2043 TGTTTTGGCTGAGGAATGTTTTACAAAAGCTCAAGATCACAGTTCTTTGTTGCTCTTATA 2102 681 --V--L--A--E--E--C--F--T--K--A--Q--D--H--S--S--L--L--L--L--Y 701 2221 TACCGCTTCCAACAATGTTGAAGGTCTTGAAAAGCTCGCTGATGCTGCCATCTCTAAGCA 2280 2103 TACCGCTTCCAACAATGTTGAAGGTCTTGAAAAGCTCGCTGATGCTGCCATCTCTAAGCA 2162 701 --T--A--S--N--N--V--E--G--L--E--K--L--A--D--A--A--I--S--K--Q 721 2281 AGTTAATAACACTGCTTTCGTTTGTTCATGGCTTACCAACCAGCCAGACAAGTGTATTGA 2340 2163 AGTTAATAACACTGCTTTCGTTTGTTCATGGCTTACCAACCAGCCAGACAAGTGTATTGA 2222 721 --V--N--N--T--A--F--V--C--S--W--L--T--N--Q--P--D--K--C--I--E 741 2341 GGTTCTGCGTTCTGGTAACCGTTTGCCGGAGGCAAGTTTCTTTGCTGCTACCTACAAACC 2400 2223 GGTTCTGCGTTCTGGTAACCGTTTGCCGGAGGCAAGTTTCTTTGCTGCTACCTACAAACC 2282 741 --V--L--R--S--G--N--R--L--P--E--A--S--F--F--A--A--T--Y--K--P 761 2401 TGAAGCCGTGAAAGAGCTGTTACCAGAGTGGAAGGAAAGCCTTGTTACGAAAAAGAAGGA 2460 2283 TGAAGCCGTGAAAGAGCTGTTACCAGAGTGGAAGGAAAGCCTTGTTACGAAAAAGAAGGA 2342 761 --E--A--V--K--E--L--L--P--E--W--K--E--S--L--V--T--K--K--K--E 781 2461 AAGAATCGCGAATGCACTTGATGACATTTAAGCCCTTTTAAAACATTCGTTCTAAAGAAT 2520 2343 AAGAATCGCGAATGCACTTGATGACATTTAA............................. 2373 781 --R--I--A--N--A--L--D--D--I--*-............................. 790 2521 CTGCATACGTTGTAGACATTAATATCAAGTAACCGCACATTTTTATGACTGTTTAATACT 2580 ............................................................ ............................................................ 2581 CACAGAGGCTACATGTTTGAAATAAACACGCGTGATTCAGGATTCTGTTGTAGTGACAGA 2640 ............................................................ ............................................................ 2641 TACTCATTCTACAGTAAGTCTACGAGTACACTGTTTGTTCTAAAAGCTGTGTAATACAAA 2700 ............................................................ ............................................................ 2701 TGGCCGCGCACCTATCAAGGAGGGAAAAGCGCAGCTTTATATGGGAACGGATGAGAGAGG 2760 ............................................................ ............................................................ 2761 TCATGCGAAGGAAATCGCTACAACCGAGCAGTGTGAATTGGCGAAGTAAGGTACACGATC 2820 ............................................................ ............................................................ 2821 TAAACTACTGTAAAAGAAGGAGCGGAGAGATGTATAAATCAGAACGATAAACTGGTTTGA 2880 ............................................................ ............................................................ 2881 ACGAATGTAGAGGAGTAATGCTTTTAAATTTGCGTGGGAGAGTGTGAAAGATTAGTGAAT 2940 ............................................................ ............................................................ 2941 GAATGGCACAGACAAATTTGAAGCGAATTACAGTGATTTTTTGATTGTGCCAAAGAAAGA 3000 ............................................................ ............................................................ 3001 GAGAGGGAGAAAGAGAGAAAAAAAAAAATAAAAAGAGAGAAAGACAATAAAGAGTGTGGG 3060 ............................................................ ............................................................ 3061 ATTGTGTTTGTAAGCTGAATTGTTTGTTG 3089 ............................. .............................
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