Schizosaccharomyces japonicus (GCA_000149845.2)
Description

App1 protein

About this transcript

This transcript has 4 exons and is annotated with 45 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene SJAG_02566 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
SJAG_02566-1EEB074812298765aa
 
Protein coding
B6K0L0 -Ensembl Canonical
Variants
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Markup
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     1 ATGTCTTTTCAGATTGATACGAGTACTAACGGCAGAGATATAAATGCTGTGTATGAGCGA     60
     1 ATGTCTTTTCAGATTGATACGAGTACTAACGGCAGAGATATAAATGCTGTGTATGAGCGA     60
     1 -M--S--F--Q--I--D--T--S--T--N--G--R--D--I--N--A--V--Y--E--R-     20

                                                                          
    61 ATTCTCAATGATGATCCCGCGTGTTCGTGGGCTGTTTTTGGTTACGATAAGGGCAGTCAA    120
    61 ATTCTCAATGATGATCCCGCGTGTTCGTGGGCTGTTTTTGGTTACGATAAGGGCAGTCAA    120
    21 -I--L--N--D--D--P--A--C--S--W--A--V--F--G--Y--D--K--G--S--Q-     40

                                                                          
   121 ACGAGATTGAAAGTTGTGGCTTCCGGAGACGACAAAGACGAATTCTTGGAAGAGTTTGAC    180
   121 ACGAGATTGAAAGTTGTGGCTTCCGGAGACGACAAAGACGAATTCTTGGAAGAGTTTGAC    180
    41 -T--R--L--K--V--V--A--S--G--D--D--K--D--E--F--L--E--E--F--D-     60

                                                                          
   181 GAAAGTGCGGTTTTGTATGGTTTTTTGCGCGTTAAAGATGAAAATACACAATTGAACAAG    240
   181 GAAAGTGCGGTTTTGTATGGTTTTTTGCGCGTTAAAGATGAAAATACACAATTGAACAAG    240
    61 -E--S--A--V--L--Y--G--F--L--R--V--K--D--E--N--T--Q--L--N--K-     80

                                                                          
   241 TTTGTACTTATTGGCTGGTGCGGAGAGGCCGCTCCTGGTTACAGAAAAGGCTTGTTCAAC    300
   241 TTTGTACTTATTGGCTGGTGCGGAGAGGCCGCTCCTGGTTACAGAAAAGGCTTGTTCAAC    300
    81 -F--V--L--I--G--W--C--G--E--A--A--P--G--Y--R--K--G--L--F--N-    100

                                                                          
   301 ACGCATCTGGCTTCTGTGACTAAGTTATTACCGACATATCATGTTCAAATTACGGGCCGT    360
   301 ACGCATCTGGCTTCTGTGACTAAGTTATTACCGACATATCATGTTCAAATTACGGGCCGT    360
   101 -T--H--L--A--S--V--T--K--L--L--P--T--Y--H--V--Q--I--T--G--R-    120

                                                                          
   361 TCTGCTGGAGATATTGATTTCGACGACATTATGAAACGCGTCGCCGATGCTAGCGGCAGC    420
   361 TCTGCTGGAGATATTGATTTCGACGACATTATGAAACGCGTCGCCGATGCTAGCGGCAGC    420
   121 -S--A--G--D--I--D--F--D--D--I--M--K--R--V--A--D--A--S--G--S-    140

                                                                          
   421 AAATACACTCATAGAGGCGAAAGCTTCGTTGCTTCTCGTCGTCCCGTTGCTTCTTTCCAA    480
   421 AAATACACTCATAGAGGCGAAAGCTTCGTTGCTTCTCGTCGTCCCGTTGCTTCTTTCCAA    480
   141 -K--Y--T--H--R--G--E--S--F--V--A--S--R--R--P--V--A--S--F--Q-    160

                                                                          
   481 CGTCCTCCTCCTGCTACAAAATCAACTGCTCCTAAATTACAACACCCTACCATTGCTCCC    540
   481 CGTCCTCCTCCTGCTACAAAATCAACTGCTCCTAAATTACAACACCCTACCATTGCTCCC    540
   161 -R--P--P--P--A--T--K--S--T--A--P--K--L--Q--H--P--T--I--A--P-    180

                                                                          
   541 AGTCTTCCTAAAAAGTCGACACAAACGAAAACAACGGTGGATGAATGGGCAGACACAAAA    600
   541 AGTCTTCCTAAAAAGTCGACACAAACGAAAACAACGGTGGATGAATGGGCAGACACAAAA    600
   181 -S--L--P--K--K--S--T--Q--T--K--T--T--V--D--E--W--A--D--T--K-    200

                                                                          
   601 TCCTTGCCTCCCGTTCCTTCCAACTTGCGCATTCCAGAAAATGTAAAGCCATCTATGTCG    660
   601 TCCTTGCCTCCCGTTCCTTCCAACTTGCGCATTCCAGAAAATGTAAAGCCATCTATGTCG    660
   201 -S--L--P--P--V--P--S--N--L--R--I--P--E--N--V--K--P--S--M--S-    220

                                                                          
   661 TCTAATGCCCCTTCTCTTCCTCCGTCGAAGCCAGCTACGAGCTCTATTCCTACTCCAGCA    720
   661 TCTAATGCCCCTTCTCTTCCTCCGTCGAAGCCAGCTACGAGCTCTATTCCTACTCCAGCA    720
   221 -S--N--A--P--S--L--P--P--S--K--P--A--T--S--S--I--P--T--P--A-    240

                                                                          
   721 CCTTCAAAGGCTGTCGAGTCCCAACACGCAGATTCTGCACATTTGCAGCCGCCTGCAACT    780
   721 CCTTCAAAGGCTGTCGAGTCCCAACACGCAGATTCTGCACATTTGCAGCCGCCTGCAACT    780
   241 -P--S--K--A--V--E--S--Q--H--A--D--S--A--H--L--Q--P--P--A--T-    260

                                                                          
   781 AGTTCCATTGATACTAACCGCCCTTCTTCTGCACTTTCAGCCTCTAGCCGCTCCACGACT    840
   781 AGTTCCATTGATACTAACCGCCCTTCTTCTGCACTTTCAGCCTCTAGCCGCTCCACGACT    840
   261 -S--S--I--D--T--N--R--P--S--S--A--L--S--A--S--S--R--S--T--T-    280

                                                                          
   841 GAGCTTGGTGAACTGCAGGCTTCAGGCGCTGTTGACCTTGATGCTCGAAAAGCTCTCTTT    900
   841 GAGCTTGGTGAACTGCAGGCTTCAGGCGCTGTTGACCTTGATGCTCGAAAAGCTCTCTTT    900
   281 -E--L--G--E--L--Q--A--S--G--A--V--D--L--D--A--R--K--A--L--F-    300

                                                                          
   901 GAACGCCCGGGTGCCCAGAAATCGACACTTCCTCCTGCCCCTGCCCCTGCCGTGAAGCAT    960
   901 GAACGCCCGGGTGCCCAGAAATCGACACTTCCTCCTGCCCCTGCCCCTGCCGTGAAGCAT    960
   301 -E--R--P--G--A--Q--K--S--T--L--P--P--A--P--A--P--A--V--K--H-    320

                                                                          
   961 CAGATAAAACGGGCTCCTACGGTTTCTGTCCCGGCAAATGCTCCTGCTTCTGCTCCTGCT   1020
   961 CAGATAAAACGGGCTCCTACGGTTTCTGTCCCGGCAAATGCTCCTGCTTCTGCTCCTGCT   1020
   321 -Q--I--K--R--A--P--T--V--S--V--P--A--N--A--P--A--S--A--P--A-    340

                                                                          
  1021 GCTGCCGCTGCTGCTGCTGAAGAGGAGGAATCTCACCTCAGCGTTTCACAATTACGCGCT   1080
  1021 GCTGCCGCTGCTGCTGCTGAAGAGGAGGAATCTCACCTCAGCGTTTCACAATTACGCGCT   1080
   341 -A--A--A--A--A--A--E--E--E--E--S--H--L--S--V--S--Q--L--R--A-    360

                                                                          
  1081 CGTTTTGCCAAGCAATCGGTTAACGATGGTCACTCATCACGACCTCGGGCTTCTAGCACC   1140
  1081 CGTTTTGCCAAGCAATCGGTTAACGATGGTCACTCATCACGACCTCGGGCTTCTAGCACC   1140
   361 -R--F--A--K--Q--S--V--N--D--G--H--S--S--R--P--R--A--S--S--T-    380

                                                                          
  1141 GGCCGCAACTCAACAGGCGTTGCATCACGCATACAGAGTTTGAAACGCTCCGTGACTGAA   1200
  1141 GGCCGCAACTCAACAGGCGTTGCATCACGCATACAGAGTTTGAAACGCTCCGTGACTGAA   1200
   381 -G--R--N--S--T--G--V--A--S--R--I--Q--S--L--K--R--S--V--T--E-    400

                                                                          
  1201 CAACAATCCGTTCCTCAATTACAGCAACCGTCCATTTCCAGTGCTCAAGAGACGAAACCA   1260
  1201 CAACAATCCGTTCCTCAATTACAGCAACCGTCCATTTCCAGTGCTCAAGAGACGAAACCA   1260
   401 -Q--Q--S--V--P--Q--L--Q--Q--P--S--I--S--S--A--Q--E--T--K--P-    420

                                                                          
  1261 ATTCCAGCACCCAATTTTCCTCAAGCGCCCGCCATGTCGGAGACACCGATCGCCCCGCCT   1320
  1261 ATTCCAGCACCCAATTTTCCTCAAGCGCCCGCCATGTCGGAGACACCGATCGCCCCGCCT   1320
   421 -I--P--A--P--N--F--P--Q--A--P--A--M--S--E--T--P--I--A--P--P-    440

                                                                          
  1321 GTCCCTAAAGCACCTGAATCCGTTGGCGTTTCTTCTGCCTCGGTTCCTCCACTTCCAACT   1380
  1321 GTCCCTAAAGCACCTGAATCCGTTGGCGTTTCTTCTGCCTCGGTTCCTCCACTTCCAACT   1380
   441 -V--P--K--A--P--E--S--V--G--V--S--S--A--S--V--P--P--L--P--T-    460

                                                                          
  1381 GCATCCCGGCCTTCTGCTGAGGTAGAAACTTCAGTGCCTCCCCCCATTCCTCAAGAACCA   1440
  1381 GCATCCCGGCCTTCTGCTGAGGTAGAAACTTCAGTGCCTCCCCCCATTCCTCAAGAACCA   1440
   461 -A--S--R--P--S--A--E--V--E--T--S--V--P--P--P--I--P--Q--E--P-    480

                                                                          
  1441 AGAATGGAAAAGGAGCAGGAAGTACCAATTGCGACAAAGCAGGAGGCTCCTGTAATCCCA   1500
  1441 AGAATGGAAAAGGAGCAGGAAGTACCAATTGCGACAAAGCAGGAGGCTCCTGTAATCCCA   1500
   481 -R--M--E--K--E--Q--E--V--P--I--A--T--K--Q--E--A--P--V--I--P-    500

                                                                          
  1501 CAGGCACCAGAGCCCGTAAATGAGGAAGCTCCCATCGTCTCTCCTGCACCACAGGTTGCA   1560
  1501 CAGGCACCAGAGCCCGTAAATGAGGAAGCTCCCATCGTCTCTCCTGCACCACAGGTTGCA   1560
   501 -Q--A--P--E--P--V--N--E--E--A--P--I--V--S--P--A--P--Q--V--A-    520

                                                                          
  1561 AAAGAAGAGGTTCCAGCCGTACCTCCTATTCCTACAGCTCCCAGACCCTCAAATGCTGTA   1620
  1561 AAAGAAGAGGTTCCAGCCGTACCTCCTATTCCTACAGCTCCCAGACCCTCAAATGCTGTA   1620
   521 -K--E--E--V--P--A--V--P--P--I--P--T--A--P--R--P--S--N--A--V-    540

                                                                          
  1621 GAAGAATCTGTTGCACCCACTGTGCCACCTGTCCCTACAGCTCCTGCTGCTCCTGCTGCT   1680
  1621 GAAGAATCTGTTGCACCCACTGTGCCACCTGTCCCTACAGCTCCTGCTGCTCCTGCTGCT   1680
   541 -E--E--S--V--A--P--T--V--P--P--V--P--T--A--P--A--A--P--A--A-    560

                                                                          
  1681 CCTGTTACTCCTGTTGCTCCTACTGCTCCTGTTGCTCCTCCCGCACCCGCTGCTCCTGTT   1740
  1681 CCTGTTACTCCTGTTGCTCCTACTGCTCCTGTTGCTCCTCCCGCACCCGCTGCTCCTGTT   1740
   561 -P--V--T--P--V--A--P--T--A--P--V--A--P--P--A--P--A--A--P--V-    580

                                                                          
  1741 GCTCCTATTGCTCCCACTGCCCCTACTGCCCCTGTTGCTCCTCCCGCACCCGCTGCTCCT   1800
  1741 GCTCCTATTGCTCCCACTGCCCCTACTGCCCCTGTTGCTCCTCCCGCACCCGCTGCTCCT   1800
   581 -A--P--I--A--P--T--A--P--T--A--P--V--A--P--P--A--P--A--A--P-    600

                                                                          
  1801 GTCGTTGCAAACGTCGCCAATGAGCCAGCTGTTCCAGCAATCCCTGCAGAGCCTGTCGCT   1860
  1801 GTCGTTGCAAACGTCGCCAATGAGCCAGCTGTTCCAGCAATCCCTGCAGAGCCTGTCGCT   1860
   601 -V--V--A--N--V--A--N--E--P--A--V--P--A--I--P--A--E--P--V--A-    620

                                                                          
  1861 TCTTCACATCCGGTTGTTCCTGGAGCCATTGCTTATGCTACAGCGCTCTATGACTACGAG   1920
  1861 TCTTCACATCCGGTTGTTCCTGGAGCCATTGCTTATGCTACAGCGCTCTATGACTACGAG   1920
   621 -S--S--H--P--V--V--P--G--A--I--A--Y--A--T--A--L--Y--D--Y--E-    640

                                                                          
  1921 CCGGAAGAGGAGAACGAGTTGAAGCTTACCGAGAATCAACGGATTGCCATTCTCGAGTTT   1980
  1921 CCGGAAGAGGAGAACGAGTTGAAGCTTACCGAGAATCAACGGATTGCCATTCTCGAGTTT   1980
   641 -P--E--E--E--N--E--L--K--L--T--E--N--Q--R--I--A--I--L--E--F-    660

                                                                          
  1981 GTCGATGAAGGATGGTGGTTGGGTGTCAATGAAACTGGCGCTCAGGGTCTATTTCCTGCA   2040
  1981 GTCGATGAAGGATGGTGGTTGGGTGTCAATGAAACTGGCGCTCAGGGTCTATTTCCTGCA   2040
   661 -V--D--E--G--W--W--L--G--V--N--E--T--G--A--Q--G--L--F--P--A-    680

                                                                          
  2041 AACTATGTTGAAGTGACCGAGGGAAACAATCCTGCAACCACTGCTACCGCCCCTCAAACT   2100
  2041 AACTATGTTGAAGTGACCGAGGGAAACAATCCTGCAACCACTGCTACCGCCCCTCAAACT   2100
   681 -N--Y--V--E--V--T--E--G--N--N--P--A--T--T--A--T--A--P--Q--T-    700

                                                                          
  2101 TCTCAGTCTGCCGGAGAAGAGGATTCTGGCGTTATGGTGCGAGCTCTCTATGACTATGTC   2160
  2101 TCTCAGTCTGCCGGAGAAGAGGATTCTGGCGTTATGGTGCGAGCTCTCTATGACTATGTC   2160
   701 -S--Q--S--A--G--E--E--D--S--G--V--M--V--R--A--L--Y--D--Y--V-    720

                                                                          
  2161 GCCCAGGAGGATAACGAAATTTCATTCTTCGAGAACGACCTCATAAAGGAAGTTGATTTC   2220
  2161 GCCCAGGAGGATAACGAAATTTCATTCTTCGAGAACGACCTCATAAAGGAAGTTGATTTC   2220
   721 -A--Q--E--D--N--E--I--S--F--F--E--N--D--L--I--K--E--V--D--F-    740

                                                                          
  2221 ATTGACAAGGACTGGTGGGTCGGCACTTGTCACGGAAGACGTGGAATGTTTCCTGCAAAC   2280
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   741 -I--D--K--D--W--W--V--G--T--C--H--G--R--R--G--M--F--P--A--N-    760

                                                                          
  2281 TACGTCGAACGAATTTAA                                             2298
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   761 -Y--V--E--R--I--*-                                              765