Pyrenophora teres (GCA_000166005.1)
Description

hypothetical protein

Location
About this transcript

This transcript has 7 exons and is annotated with 18 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene PTT_17062 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
PTT_17062-1EFQ87445687228aa
 
Protein coding
E3S3K9 -Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGCCTCCCGCCCTCAGCGACCACGAATCCTCGGATGTCGAAAGCGTACCCGCCAAGGGA     60
     1 ATGCCTCCCGCCCTCAGCGACCACGAATCCTCGGATGTCGAAAGCGTACCCGCCAAGGGA     60
     1 -M--P--P--A--L--S--D--H--E--S--S--D--V--E--S--V--P--A--K--G-     20

                                                                          
    61 AGGGGGAAAGCCAAGCAGCCACAAGTCGAGCCAGAGCCAGAGCCGGTAGACGACGAGGAC    120
    61 AGGGGGAAAGCCAAGCAGCCACAAGTCGAGCCAGAGCCAGAGCCGGTAGACGACGAGGAC    120
    21 -R--G--K--A--K--Q--P--Q--V--E--P--E--P--E--P--V--D--D--E--D-     40

                                                                          
   121 GAGGATGACAGTGAAGTTGGAGAGGACGAATTTGTCGTCGAGGCAATCCATGGTCATCGG    180
   121 GAGGATGACAGTGAAGTTGGAGAGGACGAATTTGTCGTCGAGGCAATCCATGGTCATCGG    180
    41 -E--D--D--S--E--V--G--E--D--E--F--V--V--E--A--I--H--G--H--R-     60

                                                                          
   181 TTTCAGAAGGGCGTCCTCCAATTCGACGTGAAATGGGAAGGGTATGACGACCCCAAGGAC    240
   181 TTTCAGAAGGGCGTCCTCCAATTCGACGTGAAATGGGAAGGGTATGACGACCCCAAGGAC    240
    61 -F--Q--K--G--V--L--Q--F--D--V--K--W--E--G--Y--D--D--P--K--D-     80

                                                                          
   241 AGAACTTGGGAGACGGAAGAGAACATGGAGGGTGCCATCGATGTCATGAATGAGTACTTT    300
   241 AGAACTTGGGAGACGGAAGAGAACATGGAGGGTGCCATCGATGTCATGAATGAGTACTTT    300
    81 -R--T--W--E--T--E--E--N--M--E--G--A--I--D--V--M--N--E--Y--F-    100

                                                                          
   301 GCAAAGATTGGCGGACGTCCAGAGCCCAAGGGACAAAAGCGGAAGGGACGACCATCAGTC    360
   301 GCAAAGATTGGCGGACGTCCAGAGCCCAAGGGACAAAAGCGGAAGGGACGACCATCAGTC    360
   101 -A--K--I--G--G--R--P--E--P--K--G--Q--K--R--K--G--R--P--S--V-    120

                                                                          
   361 TCAGGCCCCAAATCAAACGCTGGCACACCCACAGCCAGTGTCAAGCGGGCAAAGCAGGAC    420
   361 TCAGGCCCCAAATCAAACGCTGGCACACCCACAGCCAGTGTCAAGCGGGCAAAGCAGGAC    420
   121 -S--G--P--K--S--N--A--G--T--P--T--A--S--V--K--R--A--K--Q--D-    140

                                                                          
   421 AAGCTTGCAAAAGCACAACCCCTGTGGAGCCCACCCCCAGGCTCGTGGGAGCACGATGTC    480
   421 AAGCTTGCAAAAGCACAACCCCTGTGGAGCCCACCCCCAGGCTCGTGGGAGCACGATGTC    480
   141 -K--L--A--K--A--Q--P--L--W--S--P--P--P--G--S--W--E--H--D--V-    160

                                                                          
   481 AGTCATATTGACACGGTCGAGGAGAAGGCCGATCCCAAGACAGGTGAACTTGGCAGATTT    540
   481 AGTCATATTGACACGGTCGAGGAGAAGGCCGATCCCAAGACAGGTGAACTTGGCAGATTT    540
   161 -S--H--I--D--T--V--E--E--K--A--D--P--K--T--G--E--L--G--R--F-    180

                                                                          
   541 GCCTACATCGTATGGCTCAACCACCAAAAGACGCAGCATCCCCTCAAGCACGTCTACCAA    600
   541 GCCTACATCGTATGGCTCAACCACCAAAAGACGCAGCATCCCCTCAAGCACGTCTACCAA    600
   181 -A--Y--I--V--W--L--N--H--Q--K--T--Q--H--P--L--K--H--V--Y--Q-    200

                                                                          
   601 AAATGCCCACAAAAGATGTTGGAATACTACGAAAGCCACCTAGTTTTTACGAACAACGCC    660
   601 AAATGCCCACAAAAGATGTTGGAATACTACGAAAGCCACCTAGTTTTTACGAACAACGCC    660
   201 -K--C--P--Q--K--M--L--E--Y--Y--E--S--H--L--V--F--T--N--N--A-    220

                                                                          
   661 GACGGAACGCTAAATGGTGACGACTAG                                     687
   661 GACGGAACGCTAAATGGTGACGACTAG                                     687
   221 -D--G--T--L--N--G--D--D--*-                                     228