Puccinia graminis (ASM14992v1)
Description

hypothetical protein

About this transcript

This transcript has 5 exons and is annotated with 4 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene PGTG_16118 Show transcript tableHide transcript table

Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • RefSeq
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
PGTG_16118/EFP90358EFP903582118705aa
 
Protein coding
E3L1D3 -Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGTCTCAGCCTGCCTCTCAAAGCAATGGACCAAGAAGATACCGAACCGAAGCATCCAAG     60
     1 ATGTCTCAGCCTGCCTCTCAAAGCAATGGACCAAGAAGATACCGAACCGAAGCATCCAAG     60
     1 -M--S--Q--P--A--S--Q--S--N--G--P--R--R--Y--R--T--E--A--S--K-     20

                                                                          
    61 ATTACAGCGATCCTTGATCTCATGTCCGAAATGGACCACGATCCCAAATCGTTCATGATC    120
    61 ATTACAGCGATCCTTGATCTCATGTCCGAAATGGACCACGATCCCAAATCGTTCATGATC    120
    21 -I--T--A--I--L--D--L--M--S--E--M--D--H--D--P--K--S--F--M--I-     40

                                                                          
   121 TCCTTTCTCCGCATTAAGAACAATCAGGCGGCTGTCCAGAGAAGATATTGGCGTACCCCG    180
   121 TCCTTTCTCCGCATTAAGAACAATCAGGCGGCTGTCCAGAGAAGATATTGGCGTACCCCG    180
    41 -S--F--L--R--I--K--N--N--Q--A--A--V--Q--R--R--Y--W--R--T--P-     60

                                                                          
   181 AGAGGTTGGGAGGGCACCTCGGCTATGATAGATGCGATTCGTGATTTCATCTGCACAGAT    240
   181 AGAGGTTGGGAGGGCACCTCGGCTATGATAGATGCGATTCGTGATTTCATCTGCACAGAT    240
    61 -R--G--W--E--G--T--S--A--M--I--D--A--I--R--D--F--I--C--T--D-     80

                                                                          
   241 CAAACAGGAAAAGCCTTTTGGGAAGAACAAATGCTTTCCGAGGCCACCAGGATTGTAGTG    300
   241 CAAACAGGAAAAGCCTTTTGGGAAGAACAAATGCTTTCCGAGGCCACCAGGATTGTAGTG    300
    81 -Q--T--G--K--A--F--W--E--E--Q--M--L--S--E--A--T--R--I--V--V-    100

                                                                          
   301 CGTCAAAGACCTCCTAGCGGTATTTTTCCTGAAGGCGGTTACTACAGTACAAAGAAAATC    360
   301 CGTCAAAGACCTCCTAGCGGTATTTTTCCTGAAGGCGGTTACTACAGTACAAAGAAAATC    360
   101 -R--Q--R--P--P--S--G--I--F--P--E--G--G--Y--Y--S--T--K--K--I-    120

                                                                          
   361 ACTCCGGAGTTTTTTGACGATGACAAACAAGATATGCGAGAGGAGGAACTCACTCGAACC    420
   361 ACTCCGGAGTTTTTTGACGATGACAAACAAGATATGCGAGAGGAGGAACTCACTCGAACC    420
   121 -T--P--E--F--F--D--D--D--K--Q--D--M--R--E--E--E--L--T--R--T-    140

                                                                          
   421 CATACACCTTTCTTATTCAACCTACTCTATAACAAGATGACTCAGGGAAGGAAAAAGCAA    480
   421 CATACACCTTTCTTATTCAACCTACTCTATAACAAGATGACTCAGGGAAGGAAAAAGCAA    480
   141 -H--T--P--F--L--F--N--L--L--Y--N--K--M--T--Q--G--R--K--K--Q-    160

                                                                          
   481 TCCGTTGAAGAAGAAGACAAAGACCCGAATGGTTTTGAACAGCTTGAAAATGAAGACCAA    540
   481 TCCGTTGAAGAAGAAGACAAAGACCCGAATGGTTTTGAACAGCTTGAAAATGAAGACCAA    540
   161 -S--V--E--E--E--D--K--D--P--N--G--F--E--Q--L--E--N--E--D--Q-    180

                                                                          
   541 GAGTTGGATACAAATACAAACAGTGATTTTTTCCGGGAAACTCTTGTGGCACCAATCCAC    600
   541 GAGTTGGATACAAATACAAACAGTGATTTTTTCCGGGAAACTCTTGTGGCACCAATCCAC    600
   181 -E--L--D--T--N--T--N--S--D--F--F--R--E--T--L--V--A--P--I--H-    200

                                                                          
   601 TTAGATCATCACACAAGAGCAAAAAAGACAGCCACAGTTGCATGCTCAATGGTGTCCTTT    660
   601 TTAGATCATCACACAAGAGCAAAAAAGACAGCCACAGTTGCATGCTCAATGGTGTCCTTT    660
   201 -L--D--H--H--T--R--A--K--K--T--A--T--V--A--C--S--M--V--S--F-    220

                                                                          
   661 ATTCTTAATCGACGAATCAATGGAATGCAATTAGCAAATTCTCTGACCTTTCTAGCCTCT    720
   661 ATTCTTAATCGACGAATCAATGGAATGCAATTAGCAAATTCTCTGACCTTTCTAGCCTCT    720
   221 -I--L--N--R--R--I--N--G--M--Q--L--A--N--S--L--T--F--L--A--S-    240

                                                                          
   721 GGGGTTTCAGATCGAGTCAATCACTATTTAAATTATATTGGGCTGGCGTCATCACGAAGA    780
   721 GGGGTTTCAGATCGAGTCAATCACTATTTAAATTATATTGGGCTGGCGTCATCACGAAGA    780
   241 -G--V--S--D--R--V--N--H--Y--L--N--Y--I--G--L--A--S--S--R--R-    260

                                                                          
   781 ACAGCTCATCGTTCTCTGGAAGTCCTTGGTTTGCATGCAGAAAAAGTTATCAAAAAGAAG    840
   781 ACAGCTCATCGTTCTCTGGAAGTCCTTGGTTTGCATGCAGAAAAAGTTATCAAAAAGAAG    840
   261 -T--A--H--R--S--L--E--V--L--G--L--H--A--E--K--V--I--K--K--K-    280

                                                                          
   841 ATGTCGCAATCAGAAGCTCAAATCATGCCCCCGTTTCTTTGCATTGACAACCTGGATTTC    900
   841 ATGTCGCAATCAGAAGCTCAAATCATGCCCCCGTTTCTTTGCATTGACAACCTGGATTTC    900
   281 -M--S--Q--S--E--A--Q--I--M--P--P--F--L--C--I--D--N--L--D--F-    300

                                                                          
   901 GAGCAACGAGTCCACGCAAAGTCCCTCGGACACACAAGTAAGATGTTTCATGGGACATGG    960
   901 GAGCAACGAGTCCACGCAAAGTCCCTCGGACACACAAGTAAGATGTTTCATGGGACATGG    960
   301 -E--Q--R--V--H--A--K--S--L--G--H--T--S--K--M--F--H--G--T--W-    320

                                                                          
   961 GGTTACATACATCATTTAAACCCCATGCTAGTTTCATCAGTTCCAGCTGGCGACCTATCT   1020
   961 GGTTACATACATCATTTAAACCCCATGCTAGTTTCATCAGTTCCAGCTGGCGACCTATCT   1020
   321 -G--Y--I--H--H--L--N--P--M--L--V--S--S--V--P--A--G--D--L--S-    340

                                                                          
  1021 CTCGAAAGTTACACTGCTTCGATGAAAAACGCAGCCGATATCGATGTTACTCCTACCATG   1080
  1021 CTCGAAAGTTACACTGCTTCGATGAAAAACGCAGCCGATATCGATGTTACTCCTACCATG   1080
   341 -L--E--S--Y--T--A--S--M--K--N--A--A--D--I--D--V--T--P--T--M-    360

                                                                          
  1081 TTTCTTGCATCAAAAGACGAGGAGCAACATTGGACGAGCGTCTTGAAATGTCAGATTGCA   1140
  1081 TTTCTTGCATCAAAAGACGAGGAGCAACATTGGACGAGCGTCTTGAAATGTCAGATTGCA   1140
   361 -F--L--A--S--K--D--E--E--Q--H--W--T--S--V--L--K--C--Q--I--A-    380

                                                                          
  1141 AAAGTGATCCTTGAATACATTGCCATCCCCTCCGACAAAGATTTTCCAATCCCCTCAAGC   1200
  1141 AAAGTGATCCTTGAATACATTGCCATCCCCTCCGACAAAGATTTTCCAATCCCCTCAAGC   1200
   381 -K--V--I--L--E--Y--I--A--I--P--S--D--K--D--F--P--I--P--S--S-    400

                                                                          
  1201 CCACCAGTTGTTGAACAAATATCGCACAACCGCCCAGACATAACCATGCTCAAGCTCATG   1260
  1201 CCACCAGTTGTTGAACAAATATCGCACAACCGCCCAGACATAACCATGCTCAAGCTCATG   1260
   401 -P--P--V--V--E--Q--I--S--H--N--R--P--D--I--T--M--L--K--L--M-    420

                                                                          
  1261 GTCGCATCAGACAACTCAGCGCAAGGAGTTGAGGATGTATGCACCGGCATCATCCAACAG   1320
  1261 GTCGCATCAGACAACTCAGCGCAAGGAGTTGAGGATGTATGCACCGGCATCATCCAACAG   1320
   421 -V--A--S--D--N--S--A--Q--G--V--E--D--V--C--T--G--I--I--Q--Q-    440

                                                                          
  1321 ACAAATCTCAGCAAAACACAGTTCTACAACCGTCTTCTCATGCTTGATGGCGATTTAGGC   1380
  1321 ACAAATCTCAGCAAAACACAGTTCTACAACCGTCTTCTCATGCTTGATGGCGATTTAGGC   1380
   441 -T--N--L--S--K--T--Q--F--Y--N--R--L--L--M--L--D--G--D--L--G-    460

                                                                          
  1381 ACATGTGTCAATGTAAAGTGTCTTCAGAACCAGCGGTTTCCTAGCTCACATGTAGAAAAC   1440
  1381 ACATGTGTCAATGTAAAGTGTCTTCAGAACCAGCGGTTTCCTAGCTCACATGTAGAAAAC   1440
   461 -T--C--V--N--V--K--C--L--Q--N--Q--R--F--P--S--S--H--V--E--N-    480

                                                                          
  1441 AGCCTTGACAACATCTGTACTCTTCTCGGTGGAGCACACACCCTATGGAACATTGGCCAT   1500
  1441 AGCCTTGACAACATCTGTACTCTTCTCGGTGGAGCACACACCCTATGGAACATTGGCCAT   1500
   481 -S--L--D--N--I--C--T--L--L--G--G--A--H--T--L--W--N--I--G--H-    500

                                                                          
  1501 GCAATCTACACCAAACACTTCGGGAATTCTTCAGACTCGCGCGATTCAGGAGCCTGGAGG   1560
  1501 GCAATCTACACCAAACACTTCGGGAATTCTTCAGACTCGCGCGATTCAGGAGCCTGGAGG   1560
   501 -A--I--Y--T--K--H--F--G--N--S--S--D--S--R--D--S--G--A--W--R-    520

                                                                          
  1561 TACCTGGAATCACTTGGAATTCCATCACGTAAAACCCTTGACAAGAAGGACTTTACTCTG   1620
  1561 TACCTGGAATCACTTGGAATTCCATCACGTAAAACCCTTGACAAGAAGGACTTTACTCTG   1620
   521 -Y--L--E--S--L--G--I--P--S--R--K--T--L--D--K--K--D--F--T--L-    540

                                                                          
  1621 ATGATAGATAACATGATCAAAATCCATGAAGCTACACTTGTGCACTGTATCATGCTTGTG   1680
  1621 ATGATAGATAACATGATCAAAATCCATGAAGCTACACTTGTGCACTGTATCATGCTTGTG   1680
   541 -M--I--D--N--M--I--K--I--H--E--A--T--L--V--H--C--I--M--L--V-    560

                                                                          
  1681 ATGGGAAAAGAAAACATCTCATTGGATCCTGAACCTCAATCACTCCCATCAAAGGATATT   1740
  1681 ATGGGAAAAGAAAACATCTCATTGGATCCTGAACCTCAATCACTCCCATCAAAGGATATT   1740
   561 -M--G--K--E--N--I--S--L--D--P--E--P--Q--S--L--P--S--K--D--I-    580

                                                                          
  1741 GTTTCAATCATCAATTCCACCTACACTCGATTTTTCTCAGCAAAATCAAGGGTTGATGCA   1800
  1741 GTTTCAATCATCAATTCCACCTACACTCGATTTTTCTCAGCAAAATCAAGGGTTGATGCA   1800
   581 -V--S--I--I--N--S--T--Y--T--R--F--F--S--A--K--S--R--V--D--A-    600

                                                                          
  1801 AGCAAAAGGCCATCACCAAAGCTCTCAAATCTCCAGTTGCGACTATTTGACTTTGCTTCG   1860
  1801 AGCAAAAGGCCATCACCAAAGCTCTCAAATCTCCAGTTGCGACTATTTGACTTTGCTTCG   1860
   601 -S--K--R--P--S--P--K--L--S--N--L--Q--L--R--L--F--D--F--A--S-    620

                                                                          
  1861 GTTTGCGAAGCTAACGCAGCCATGAAGGCTGGAGATATTGGCCGAGTAATGTTCATGTGG   1920
  1861 GTTTGCGAAGCTAACGCAGCCATGAAGGCTGGAGATATTGGCCGAGTAATGTTCATGTGG   1920
   621 -V--C--E--A--N--A--A--M--K--A--G--D--I--G--R--V--M--F--M--W-    640

                                                                          
  1921 AAGCGCTGGGCTGTAATGGCACAGGGTATCAAAAAACTCTCAAACTACGCTGTACACCTT   1980
  1921 AAGCGCTGGGCTGTAATGGCACAGGGTATCAAAAAACTCTCAAACTACGCTGTACACCTT   1980
   641 -K--R--W--A--V--M--A--Q--G--I--K--K--L--S--N--Y--A--V--H--L-    660

                                                                          
  1981 CCTAGAATGATAGTTTTAATGAACGAGATATTACCTCCTGAATTACTCTTTGAAGTATTT   2040
  1981 CCTAGAATGATAGTTTTAATGAACGAGATATTACCTCCTGAATTACTCTTTGAAGTATTT   2040
   661 -P--R--M--I--V--L--M--N--E--I--L--P--P--E--L--L--F--E--V--F-    680

                                                                          
  2041 CTTCAACTATTCTGGACGAGGAACCGAAATCAAAAGACTGAAAGATGTTTACTCAGTCAA   2100
  2041 CTTCAACTATTCTGGACGAGGAACCGAAATCAAAAGACTGAAAGATGTTTACTCAGTCAA   2100
   681 -L--Q--L--F--W--T--R--N--R--N--Q--K--T--E--R--C--L--L--S--Q-    700

                                                                          
  2101 CATACCTTTGGTACATGA                                             2118
  2101 CATACCTTTGGTACATGA                                             2118
   701 -H--T--F--G--T--*-                                              705