Neurospora crassa (NC12)
Description

ubiquitin hydrolase L3

Location
About this transcript

This transcript has 1 exon and is annotated with 13 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene NCU06372 Show transcript tableHide transcript table

Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • RefSeq
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
-ESA428972131253aa
 
Protein coding
V5IMH7 -Ensembl Canonical
-ESA428982055253aa
 
Protein coding
V5IMH7 --
-ESA42899762253aa
 
Protein coding
V5IMH7 --
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGGCCTCCAATGAAGTTGATCCCCACGGCGGCGTCCCTGCTGCTTCCGATCGTCCGGCC     60
     1 ATGGCCTCCAATGAAGTTGATCCCCACGGCGGCGTCCCTGCTGCTTCCGATCGTCCGGCC     60
     1 -M--A--S--N--E--V--D--P--H--G--G--V--P--A--A--S--D--R--P--A-     20

                                                                          
    61 TTCATCCCCCTCGAAGCCAACCCCGAACTCATGACCAGCCTCCTCCATAAGCTCGGTCTC    120
    61 TTCATCCCCCTCGAAGCCAACCCCGAACTCATGACCAGCCTCCTCCATAAGCTCGGTCTC    120
    21 -F--I--P--L--E--A--N--P--E--L--M--T--S--L--L--H--K--L--G--L-     40

                                                                          
   121 TCGACCTCCCTCCAGGTTCACGACGTCTACTCTCTCACCGACCCAGACATGCTCGCCTTC    180
   121 TCGACCTCCCTCCAGGTTCACGACGTCTACTCTCTCACCGACCCAGACATGCTCGCCTTC    180
    41 -S--T--S--L--Q--V--H--D--V--Y--S--L--T--D--P--D--M--L--A--F-     60

                                                                          
   181 ATCCCGCGCCCTGCCTTGGCCCTGCTGATGGTCTTCCCCGTCTCGGCCGCCTACGAATCG    240
   181 ATCCCGCGCCCTGCCTTGGCCCTGCTGATGGTCTTCCCCGTCTCGGCCGCCTACGAATCG    240
    61 -I--P--R--P--A--L--A--L--L--M--V--F--P--V--S--A--A--Y--E--S-     80

                                                                          
   241 GCTCGCCTCGCTGAGGACTCTCTCCTCGAAGACTACTCAGGCAAGGGTCCCCTAGAGCCT    300
   241 GCTCGCCTCGCTGAGGACTCTCTCCTCGAAGACTACTCAGGCAAGGGTCCCCTAGAGCCT    300
    81 -A--R--L--A--E--D--S--L--L--E--D--Y--S--G--K--G--P--L--E--P-    100

                                                                          
   301 GTTCTCTGGTTTCGCCAGACAATCCGCAACGCCTGCGGTCTGATGGGTCTGCTTCATGCG    360
   301 GTTCTCTGGTTTCGCCAGACAATCCGCAACGCCTGCGGTCTGATGGGTCTGCTTCATGCG    360
   101 -V--L--W--F--R--Q--T--I--R--N--A--C--G--L--M--G--L--L--H--A-    120

                                                                          
   361 GCCATCAACGGGCCGGCCCGCCAGCTTGTGGAAGAGGGCTCGACTTTGGACAAAATCATC    420
   361 GCCATCAACGGGCCGGCCCGCCAGCTTGTGGAAGAGGGCTCGACTTTGGACAAAATCATC    420
   121 -A--I--N--G--P--A--R--Q--L--V--E--E--G--S--T--L--D--K--I--I-    140

                                                                          
   421 AAGGATGCGACACCGCTGGATCCCGTTGCGAGGGCAAGAGTGCTGGAAACGAACTCTGAG    480
   421 AAGGATGCGACACCGCTGGATCCCGTTGCGAGGGCAAGAGTGCTGGAAACGAACTCTGAG    480
   141 -K--D--A--T--P--L--D--P--V--A--R--A--R--V--L--E--T--N--S--E-    160

                                                                          
   481 CTGGCTAATGCCCACAAGAGCGCGGCGACCCAGGGCGATACCGAAGCACCGGCCGCTACA    540
   481 CTGGCTAATGCCCACAAGAGCGCGGCGACCCAGGGCGATACCGAAGCACCGGCCGCTACA    540
   161 -L--A--N--A--H--K--S--A--A--T--Q--G--D--T--E--A--P--A--A--T-    180

                                                                          
   541 GACGAGGTCGATCTGCACTATGTCTGCTTCGTCAAGACCGAGGATGGAGGCTTGTGGGAG    600
   541 GACGAGGTCGATCTGCACTATGTCTGCTTCGTCAAGACCGAGGATGGAGGCTTGTGGGAG    600
   181 -D--E--V--D--L--H--Y--V--C--F--V--K--T--E--D--G--G--L--W--E-    200

                                                                          
   601 CTAGACGGACGCAGAAAGGGACCGCTGAAGAGGGGTGAACTTGGCAAGGACGATGATGTC    660
   601 CTAGACGGACGCAGAAAGGGACCGCTGAAGAGGGGTGAACTTGGCAAGGACGATGATGTC    660
   201 -L--D--G--R--R--K--G--P--L--K--R--G--E--L--G--K--D--D--D--V-    220

                                                                          
   661 CTGAGCCAAGCGGCGTTGACGCTTGGACCGCTCAAGTTCCTAGAGAGAGGGGGCGGCGAT    720
   661 CTGAGCCAAGCGGCGTTGACGCTTGGACCGCTCAAGTTCCTAGAGAGAGGGGGCGGCGAT    720
   221 -L--S--Q--A--A--L--T--L--G--P--L--K--F--L--E--R--G--G--G--D-    240

                                                                          
   721 TTGAGGTTCAGCTGTGTGGCACTTGCCAGCAGCTTCGATTAG                      762
   721 TTGAGGTTCAGCTGTGTGGCACTTGCCAGCAGCTTCGATTAG                      762
   241 -L--R--F--S--C--V--A--L--A--S--S--F--D--*-                      253