Neurospora crassa (NC12)
Description

F-box protein pof7

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This transcript has 2 exons and is annotated with 20 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene NCU03146 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
-EAA349592217583aa
 
Protein coding
Q7SDU6 -Ensembl Canonical
Codons
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     1 CACAACCACTTACTTCCATCCAACCCCATCACTTCCTTCATCTCACCGTACATAAAGGTA     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 GCTGTATCTCGCTAATTGTTTGGTATGATACACGGAAACCAATTCGTTACATATCTTTTC    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 ACATAGATTAAGAGGACGAACATCCACCGACATCCTGAGTTTGACTACCTCTATTACATT    180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   181 CCAAACAAGAAGGACAGACTGATGTACCTTCTTTTGGCCTTGCCCTCTTACATAATATAT    240
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   241 GCTGCTGAATAATTCTCGACTTTAATTCCCTTTTTTCTTACTTCACTTTATTGCCTGTCT    300
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   301 AGTCGCTCTTTACCACCAATCCCCCTTCACAAGCAAGATGGATACATCCGGAGAAGCCAA    360
       .....................................ATGGATACATCCGGAGAAGCCAA     23
       .....................................-M--D--T--S--G--E--A--N      8

                                                                          
   361 TCCCGACCTCGAGTCTTTCCGTGAGCAATGGAGAGCAGAGGTTCGGGCTAGACGGCCAAC    420
    24 TCCCGACCTCGAGTCTTTCCGTGAGCAATGGAGAGCAGAGGTTCGGGCTAGACGGCCAAC     83
     8 --P--D--L--E--S--F--R--E--Q--W--R--A--E--V--R--A--R--R--P--T     28

                                                                          
   421 AACCCAAGCCTCATCTTCTTCTTCCCAACAGCAACCACCCGCACCGCCACCGCCACCACC    480
    84 AACCCAAGCCTCATCTTCTTCTTCCCAACAGCAACCACCCGCACCGCCACCGCCACCACC    143
    28 --T--Q--A--S--S--S--S--S--Q--Q--Q--P--P--A--P--P--P--P--P--P     48

                                                                          
   481 ACCACATCAACAGCAACCAACACCATCTGCAGCTGAGCTTGCGGCAGAACACCATCTTCA    540
   144 ACCACATCAACAGCAACCAACACCATCTGCAGCTGAGCTTGCGGCAGAACACCATCTTCA    203
    48 --P--H--Q--Q--Q--P--T--P--S--A--A--E--L--A--A--E--H--H--L--H     68

                                                                          
   541 CCCTCGGAAACCTCCACCAGCACCGGCCAAAAAGGCTGCTGCACCACGTCAGGACTACGA    600
   204 CCCTCGGAAACCTCCACCAGCACCGGCCAAAAAGGCTGCTGCACCACGTCAGGACTACGA    263
    68 --P--R--K--P--P--P--A--P--A--K--K--A--A--A--P--R--Q--D--Y--E     88

                                                                          
   601 AGACGACTATGTTCAGCCGAGGTCTTTTGATTCACCGAACGATGAAGCTGCAGCCGCGTC    660
   264 AGACGACTATGTTCAGCCGAGGTCTTTTGATTCACCGAACGATGAAGCTGCAGCCGCGTC    323
    88 --D--D--Y--V--Q--P--R--S--F--D--S--P--N--D--E--A--A--A--A--S    108

                                                                          
   661 CACATCGACACAAGGGGAATGGACGGTAAAGAAAACAACAAAGGATCCGGTCACAGCGCT    720
   324 CACATCGACACAAGGGGAATGGACGGTAAAGAAAACAACAAAGGATCCGGTCACAGCGCT    383
   108 --T--S--T--Q--G--E--W--T--V--K--K--T--T--K--D--P--V--T--A--L    128

                                                                          
   721 TGATCATTATGAGAAAGCTGTGGAGAGAGAGGCTGCGGGCAGCTTGGGTGATAGTTTGAA    780
   384 TGATCATTATGAGAAAGCTGTGGAGAGAGAGGCTGCGGGCAGCTTGGGTGATAGTTTGAA    443
   128 --D--H--Y--E--K--A--V--E--R--E--A--A--G--S--L--G--D--S--L--K    148

                                                                          
   781 GCTTTATAGGAAGGCGTTCAGGATGGACGATAGCGTGGATCAGAAATACAAGAACAAGTA    840
   444 GCTTTATAGGAAGGCGTTCAGGATGGACGATAGCGTGGATCAGAAATACAAGAACAAGTA    503
   148 --L--Y--R--K--A--F--R--M--D--D--S--V--D--Q--K--Y--K--N--K--Y    168

                                                                          
   841 CTTTCCCAAGTCAAAGGCGAAGCCGCCTGCGACGGCTTCTCCTGGTACTGCTGGCGGTGC    900
   504 CTTTCCCAAGTCAAAGGCGAAGCCGCCTGCGACGGCTTCTCCTGGTACTGCTGGCGGTGC    563
   168 --F--P--K--S--K--A--K--P--P--A--T--A--S--P--G--T--A--G--G--A    188

                                                                          
   901 GGAGAGTGCTGCCACCGCGCCATCATCAGCGGAACAGCCGCAGACCATGAAGGAGCTGAT    960
   564 GGAGAGTGCTGCCACCGCGCCATCATCAGCGGAACAGCCGCAGACCATGAAGGAGCTGAT    623
   188 --E--S--A--A--T--A--P--S--S--A--E--Q--P--Q--T--M--K--E--L--I    208

                                                                          
   961 CAACAGCTTCGCAGGGGTAGCGATCGAGCCGGAAGGTCCTCCCGTAGAAGGGATGCCACC   1020
   624 CAACAGCTTCGCAGGGGTAGCGATCGAGCCGGAAGGTCCTCCCGTAGAAGGGATGCCACC    683
   208 --N--S--F--A--G--V--A--I--E--P--E--G--P--P--V--E--G--M--P--P    228

                                                                          
  1021 GCCTCCGTGTCCCATTGCCTCTCTTCCCGAAGAGCTTCTGGTTCACATCATGCGTGACGT   1080
   684 GCCTCCGTGTCCCATTGCCTCTCTTCCCGAAGAGCTTCTGGTTCACATCATGCGTGACGT    743
   228 --P--P--C--P--I--A--S--L--P--E--E--L--L--V--H--I--M--R--D--V    248

                                                                          
  1081 GGCAATTCTGGACGTTGCTGACTTTGTCCGTCTTGCGCAAGTTTGTAAGAGGTTCGCTTT   1140
   744 GGCAATTCTGGACGTTGCTGACTTTGTCCGTCTTGCGCAAGTTTGTAAGAGGTTCGCTTT    803
   248 --A--I--L--D--V--A--D--F--V--R--L--A--Q--V--C--K--R--F--A--F    268

                                                                          
  1141 TTTGGTCGCCACTGAAGATCGAATTTGGCGACGCATCTGCTTGGGCGACGAGTTCGGGTT   1200
   804 TTTGGTCGCCACTGAAGATCGAATTTGGCGACGCATCTGCTTGGGCGACGAGTTCGGGTT    863
   268 --L--V--A--T--E--D--R--I--W--R--R--I--C--L--G--D--E--F--G--F    288

                                                                          
  1201 TGGTAGCATGCATTATCACTGGCAGCGGCAAATTACTTGGGAGCCGCTGACGGAAGAAGA   1260
   864 TGGTAGCATGCATTATCACTGGCAGCGGCAAATTACTTGGGAGCCGCTGACGGAAGAAGA    923
   288 --G--S--M--H--Y--H--W--Q--R--Q--I--T--W--E--P--L--T--E--E--D    308

                                                                          
  1261 CCTTCTCACCGAATTCGAGGAGCAAATGCAAGCACAGGAGAAAGCCCGAGCAGAAAAGGC   1320
   924 CCTTCTCACCGAATTCGAGGAGCAAATGCAAGCACAGGAGAAAGCCCGAGCAGAAAAGGC    983
   308 --L--L--T--E--F--E--E--Q--M--Q--A--Q--E--K--A--R--A--E--K--A    328

                                                                          
  1321 CGCGGAGCTCGACACGGGCGCTGCGGATGAAGATGATGATGGAAAAACCGCAGAGACCCC   1380
   984 CGCGGAGCTCGACACGGGCGCTGCGGATGAAGATGATGATGGAAAAACCGCAGAGACCCC   1043
   328 --A--E--L--D--T--G--A--A--D--E--D--D--D--G--K--T--A--E--T--P    348

                                                                          
  1381 GGACGTTTCCCTGCTACTCCCCTTGACCCCCCAACAACGAGCAGAAAAGCACGCAGAAGA   1440
  1044 GGACGTTTCCCTGCTACTCCCCTTGACCCCCCAACAACGAGCAGAAAAGCACGCAGAAGA   1103
   348 --D--V--S--L--L--L--P--L--T--P--Q--Q--R--A--E--K--H--A--E--E    368

                                                                          
  1441 ATCGCGAGCCACCACCCTAGTCTTCTACAAGACCGTCTACAACTCCAGTTGGCTACGCAT   1500
  1104 ATCGCGAGCCACCACCCTAGTCTTCTACAAGACCGTCTACAACTCCAGTTGGCTACGCAT   1163
   368 --S--R--A--T--T--L--V--F--Y--K--T--V--Y--N--S--S--W--L--R--M    388

                                                                          
  1501 GTGGCGTCTCCGTCCCCGCATCCGCTTCAATGGCTGCTACATCAGCACCGTGAACTACAT   1560
  1164 GTGGCGTCTCCGTCCCCGCATCCGCTTCAATGGCTGCTACATCAGCACCGTGAACTACAT   1223
   388 --W--R--L--R--P--R--I--R--F--N--G--C--Y--I--S--T--V--N--Y--I    408

                                                                          
  1561 TCGCACCGGCCAGGCCAATGCTAACGCCACCACCTGGGGTAGCCCCGTGCACATCGTCAC   1620
  1224 TCGCACCGGCCAGGCCAATGCTAACGCCACCACCTGGGGTAGCCCCGTGCACATCGTCAC   1283
   408 --R--T--G--Q--A--N--A--N--A--T--T--W--G--S--P--V--H--I--V--T    428

                                                                          
  1621 CTACTACCGCTACCTGCGCTTCTTCCGTGACGGTACCGCCATCAGCCTGCTCACCACCGC   1680
  1284 CTACTACCGCTACCTGCGCTTCTTCCGTGACGGTACCGCCATCAGCCTGCTCACCACCGC   1343
   428 --Y--Y--R--Y--L--R--F--F--R--D--G--T--A--I--S--L--L--T--T--A    448

                                                                          
  1681 CGAGCCCGCCGACGTCGTCTACCACCTCACCCGCGAGGCCATGGCGCTGCATGCCGGTAA   1740
  1344 CGAGCCCGCCGACGTCGTCTACCACCTCACCCGCGAGGCCATGGCGCTGCATGCCGGTAA   1403
   448 --E--P--A--D--V--V--Y--H--L--T--R--E--A--M--A--L--H--A--G--K    468

                                                                          
  1741 GAGGCAGGCCGGTAACAACACCGCGCTTACACACCTCCCCAGCGCGCCGATGCAGTACGC   1800
  1404 GAGGCAGGCCGGTAACAACACCGCGCTTACACACCTCCCCAGCGCGCCGATGCAGTACGC   1463
   468 --R--Q--A--G--N--N--T--A--L--T--H--L--P--S--A--P--M--Q--Y--A    488

                                                                          
  1801 CCTTAAGGGCCGCTGGCGTTTGGCCTCGGCGGCGGATAACCCGGCTGCTCCTTTGAATGA   1860
  1464 CCTTAAGGGCCGCTGGCGTTTGGCCTCGGCGGCGGATAACCCGGCTGCTCCTTTGAATGA   1523
   488 --L--K--G--R--W--R--L--A--S--A--A--D--N--P--A--A--P--L--N--E    508

                                                                          
  1861 GATCGAAGGCGATTTGATTGTTGAGACAGAGGGCGTGGGCAAGTACATATATCGCTTGGA   1920
  1524 GATCGAAGGCGATTTGATTGTTGAGACAGAGGGCGTGGGCAAGTACATATATCGCTTGGA   1583
   508 --I--E--G--D--L--I--V--E--T--E--G--V--G--K--Y--I--Y--R--L--D    528

                                                                          
  1921 CCTGACGCTGAAGTCGGCGGGCAAGATGGGAGCTAAGAACAACAAGCTTGTTTGGAGGGG   1980
  1584 CCTGACGCTGAAGTCGGCGGGCAAGATGGGAGCTAAGAACAACAAGCTTGTTTGGAGGGG   1643
   528 --L--T--L--K--S--A--G--K--M--G--A--K--N--N--K--L--V--W--R--G    548

                                                                          
  1981 GTTTTATAACTATGATAGGATGACGGATGATTGGGGCGAGTTTACACTGAAGCATGATAA   2040
  1644 GTTTTATAACTATGATAGGATGACGGATGATTGGGGCGAGTTTACACTGAAGCATGATAA   1703
   548 --F--Y--N--Y--D--R--M--T--D--D--W--G--E--F--T--L--K--H--D--K    568

                                                                          
  2041 GCCGTTCTTCTTCAGTCGGGTCAAGAGCTATGGGGTTTTGGGGGAGTAGAGAGACAGAGA   2100
  1704 GCCGTTCTTCTTCAGTCGGGTCAAGAGCTATGGGGTTTTGGGGGAGTAG...........   1752
   568 --P--F--F--F--S--R--V--K--S--Y--G--V--L--G--E--*-...........    583

                                                                          
  2101 AAGAAAGAAAGAGAAAGCTTGGGGATGGTGTGCTTTGTAAAGTAAATAGAAAGACTGGAA   2160
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2161 GACGGTTGATGTTGGAATGGAATAAGATCTATACGGTTGAAGTCAAATTGTTTCCGC      2217
       .........................................................          
       .........................................................