Neurospora crassa (NC12)
Description

pre-mRNA splicing factor prp46

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About this transcript

This transcript has 2 exons and is annotated with 43 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene NCU02966 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
-EAA361172006504aa
 
Protein coding
Q1K953 -Ensembl Canonical
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     1 CTTTCATCACGCACTGCATCCAGTCTTCAACTTCAACTTTGACATCAAGTCAACAACCAC     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 GGCTCGAATTCGGATTTCATCACAACAACCGACTCAAAACCCCCTCCGGCTATATTGAAG    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 AATAATTCGCACAAAGAACCCAAACGACGAAACGACCCTACCTATCCGACATCCGACCCT    180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   181 TAAGATGGCGGCCGAGGTTGCCAACAGCGCCGCCAATGGCTCTGGCCCTGACACCAACCC    240
       ....ATGGCGGCCGAGGTTGCCAACAGCGCCGCCAATGGCTCTGGCCCTGACACCAACCC     56
       ....-M--A--A--E--V--A--N--S--A--A--N--G--S--G--P--D--T--N--P     19

                                                                          
   241 GCTCTCGACCATGATCCGCGAGAACGCTAGAAAAACGAAACTCATCTACGCCGCCACAGC    300
    57 GCTCTCGACCATGATCCGCGAGAACGCTAGAAAAACGAAACTCATCTACGCCGCCACAGC    116
    19 --L--S--T--M--I--R--E--N--A--R--K--T--K--L--I--Y--A--A--T--A     39

                                                                          
   301 CACAACTACAGATGCCTCTGGCACTTCCGGGAGAAAGCGTCTAAAACTCGACCCTGGGCT    360
   117 CACAACTACAGATGCCTCTGGCACTTCCGGGAGAAAGCGTCTAAAACTCGACCCTGGGCT    176
    39 --T--T--T--D--A--S--G--T--S--G--R--K--R--L--K--L--D--P--G--L     59

                                                                          
   361 TGCGTCAGAAGATCCCGACATCACCAAGACCGGCCTATCTCTCCGTCTCCACGCCGAGTA    420
   177 TGCGTCAGAAGATCCCGACATCACCAAGACCGGCCTATCTCTCCGTCTCCACGCCGAGTA    236
    59 --A--S--E--D--P--D--I--T--K--T--G--L--S--L--R--L--H--A--E--Y     79

                                                                          
   421 CAGCGACGTCCAGACCCTCCCCGAAGCCATTGCCTCCAAGTTGCCAGCCGGCGGACCACG    480
   237 CAGCGACGTCCAGACCCTCCCCGAAGCCATTGCCTCCAAGTTGCCAGCCGGCGGACCACG    296
    79 --S--D--V--Q--T--L--P--E--A--I--A--S--K--L--P--A--G--G--P--R     99

                                                                          
   481 CAAAAAGAAGGCCAAGCCAGCCATCGAAGAGGCTCCCTCAAAATCCGAAGAACACGCCCG    540
   297 CAAAAAGAAGGCCAAGCCAGCCATCGAAGAGGCTCCCTCAAAATCCGAAGAACACGCCCG    356
    99 --K--K--K--A--K--P--A--I--E--E--A--P--S--K--S--E--E--H--A--R    119

                                                                          
   541 CAAACTCATCGAGGGTATCCCACCGAGCAAGTCCGCCGCCGCCAACTCGAATGCTCTGGT    600
   357 CAAACTCATCGAGGGTATCCCACCGAGCAAGTCCGCCGCCGCCAACTCGAATGCTCTGGT    416
   119 --K--L--I--E--G--I--P--P--S--K--S--A--A--A--N--S--N--A--L--V    139

                                                                          
   601 CCTGTCGCGCAGCAAGCCCGGCGGCGCTGGCGCGTCGTCAACCAGACCAAATGCGCAACG    660
   417 CCTGTCGCGCAGCAAGCCCGGCGGCGCTGGCGCGTCGTCAACCAGACCAAATGCGCAACG    476
   139 --L--S--R--S--K--P--G--G--A--G--A--S--S--T--R--P--N--A--Q--R    159

                                                                          
   661 AAACGAGCCCCAAACAAACAGCCTGGCGCGGCGATCCGACGTGCTGGTACAGCCCAGGCC    720
   477 AAACGAGCCCCAAACAAACAGCCTGGCGCGGCGATCCGACGTGCTGGTACAGCCCAGGCC    536
   159 --N--E--P--Q--T--N--S--L--A--R--R--S--D--V--L--V--Q--P--R--P    179

                                                                          
   721 AGATTGGCACCCACCTTGGAAGCTTCTCAAGGTGCTTTCGGGCCATCTGGGGTGGGTGCG    780
   537 AGATTGGCACCCACCTTGGAAGCTTCTCAAGGTGCTTTCGGGCCATCTGGGGTGGGTGCG    596
   179 --D--W--H--P--P--W--K--L--L--K--V--L--S--G--H--L--G--W--V--R    199

                                                                          
   781 TGCCTTGGCAGTAGAACCGGACAACAAGTGGTTTGCCTCGGGCGCAGGCGACCGCACTAT    840
   597 TGCCTTGGCAGTAGAACCGGACAACAAGTGGTTTGCCTCGGGCGCAGGCGACCGCACTAT    656
   199 --A--L--A--V--E--P--D--N--K--W--F--A--S--G--A--G--D--R--T--I    219

                                                                          
   841 CAAGATTTGGGATTTGGCGTCAGGAGCGCTGAAGTTGACTCTTACCGGACACATCTCGAC    900
   657 CAAGATTTGGGATTTGGCGTCAGGAGCGCTGAAGTTGACTCTTACCGGACACATCTCGAC    716
   219 --K--I--W--D--L--A--S--G--A--L--K--L--T--L--T--G--H--I--S--T    239

                                                                          
   901 GGTTCGCGGATTGGCCGTGTCACCGAGACACCCATACCTGTTCTCGTGCGGTGAGGATAA    960
   717 GGTTCGCGGATTGGCCGTGTCACCGAGACACCCATACCTGTTCTCGTGCGGTGAGGATAA    776
   239 --V--R--G--L--A--V--S--P--R--H--P--Y--L--F--S--C--G--E--D--K    259

                                                                          
   961 GATGGTCAAGTGCTGGGATTTGGAGACGAACAAGGTTATCCGACATTACCACGGCCATCT   1020
   777 GATGGTCAAGTGCTGGGATTTGGAGACGAACAAGGTTATCCGACATTACCACGGCCATCT    836
   259 --M--V--K--C--W--D--L--E--T--N--K--V--I--R--H--Y--H--G--H--L    279

                                                                          
  1021 CAGCGGTGTTTATACCCTTGCGCTGCATCCTACACTGGATGTTTTGGTAACAGGCGGTCG   1080
   837 CAGCGGTGTTTATACCCTTGCGCTGCATCCTACACTGGATGTTTTGGTAACAGGCGGTCG    896
   279 --S--G--V--Y--T--L--A--L--H--P--T--L--D--V--L--V--T--G--G--R    299

                                                                          
  1081 CGACGGTGTCGCGCGTGTGTGGGATATGCGGACAAGAAGCAACATTCACGTCCTCTCTGG   1140
   897 CGACGGTGTCGCGCGTGTGTGGGATATGCGGACAAGAAGCAACATTCACGTCCTCTCTGG    956
   299 --D--G--V--A--R--V--W--D--M--R--T--R--S--N--I--H--V--L--S--G    319

                                                                          
  1141 ACACACAGGCACAGTAGCGGATCTTGTCTGTCAGGAGGCCGACCCTCAGGTCATCACAGC   1200
   957 ACACACAGGCACAGTAGCGGATCTTGTCTGTCAGGAGGCCGACCCTCAGGTCATCACAGC   1016
   319 --H--T--G--T--V--A--D--L--V--C--Q--E--A--D--P--Q--V--I--T--A    339

                                                                          
  1201 CAGCTTGGACTCGACCGTTCGCATGTGGGATCTGGCAGCCGGCAAGACGATGGGCGTCTT   1260
  1017 CAGCTTGGACTCGACCGTTCGCATGTGGGATCTGGCAGCCGGCAAGACGATGGGCGTCTT   1076
   339 --S--L--D--S--T--V--R--M--W--D--L--A--A--G--K--T--M--G--V--L    359

                                                                          
  1261 GACACATCACAAGAAGGGTGTGCGAGCGTTGACGACGCATCCAACCGAGTTTACGTTCGC   1320
  1077 GACACATCACAAGAAGGGTGTGCGAGCGTTGACGACGCATCCAACCGAGTTTACGTTCGC   1136
   359 --T--H--H--K--K--G--V--R--A--L--T--T--H--P--T--E--F--T--F--A    379

                                                                          
  1321 AACGGGTAGCACAGGCAGCATCAAGCAGTGGAAGTGTCCCGAGGGTGCTTTTATGCAGAA   1380
  1137 AACGGGTAGCACAGGCAGCATCAAGCAGTGGAAGTGTCCCGAGGGTGCTTTTATGCAGAA   1196
   379 --T--G--S--T--G--S--I--K--Q--W--K--C--P--E--G--A--F--M--Q--N    399

                                                                          
  1381 TTTTGAGGGACACAATGCCATCATCAACACGCTATCCGTGAACGACCAAAACGTCATGTT   1440
  1197 TTTTGAGGGACACAATGCCATCATCAACACGCTATCCGTGAACGACCAAAACGTCATGTT   1256
   399 --F--E--G--H--N--A--I--I--N--T--L--S--V--N--D--Q--N--V--M--F    419

                                                                          
  1441 CTCTGGTGGCGACAATGGTTCCATGAGCTTCTGGGATTGGAAGTCGGGCCATCGCTTCCA   1500
  1257 CTCTGGTGGCGACAATGGTTCCATGAGCTTCTGGGATTGGAAGTCGGGCCATCGCTTCCA   1316
   419 --S--G--G--D--N--G--S--M--S--F--W--D--W--K--S--G--H--R--F--Q    439

                                                                          
  1501 GGCTCTTGATACGATTGCTCAGCCTGGTTCACTTGATGCGGAGTCGGGTATCATGAGCTC   1560
  1317 GGCTCTTGATACGATTGCTCAGCCTGGTTCACTTGATGCGGAGTCGGGTATCATGAGCTC   1376
   439 --A--L--D--T--I--A--Q--P--G--S--L--D--A--E--S--G--I--M--S--S    459

                                                                          
  1561 GACCTTTGACAAGTCTGGCGCCCGCTTGATTTGCGGTGAAGCGGACAAGACCATTAAAAT   1620
  1377 GACCTTTGACAAGTCTGGCGCCCGCTTGATTTGCGGTGAAGCGGACAAGACCATTAAAAT   1436
   459 --T--F--D--K--S--G--A--R--L--I--C--G--E--A--D--K--T--I--K--I    479

                                                                          
  1621 ATGGGGTGAAGACCTTAGCGCGACACCAGAGTCGCATCCCCTCGAGTGGAAGCCAACATT   1680
  1437 ATGGGGTGAAGACCTTAGCGCGACACCAGAGTCGCATCCCCTCGAGTGGAAGCCAACATT   1496
   479 --W--G--E--D--L--S--A--T--P--E--S--H--P--L--E--W--K--P--T--L    499

                                                                          
  1681 GGCTAAGCGTAAATTTTAAGCATCGTGAATGGCGAGAACGGAGAATGTCATACCTCTTCC   1740
  1497 GGCTAAGCGTAAATTTTAA.........................................   1515
   499 --A--K--R--K--F--*-.........................................    504

                                                                          
  1741 TTTGCATGCAGGTTAAAGACGAGCAGGCGAAAAAGGGATATAATGGATAGACGACAAACC   1800
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1801 TGGGATAGCGTGTTAATCAACCAAATGGACTTTGACATTCAATGTTCATGAGCATCAAAC   1860
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1861 CAACGAAATCTTGTCTATATTCTTACTGTTGGGTATCATTACTATCGTTCAAAGAAGCAC   1920
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1921 ACCTAGCGTCTTGATCTCCGGATCATCACGGAAAGCCAACCTAACTTCCTCATCTCCAAC   1980
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1981 AGCCAGCCGAATCTTGCTCGGTCGCT                                     2006
       ..........................                                         
       ..........................