Melampsora larici-populina (GCA_000204055.1) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID History.
hypothetical protein
SuperContig GL883148: 198,906-202,325 reverse strand.
This transcript has 12 exons and is annotated with 12 domains and features.
This transcript is a product of gene MELLADRAFT_118051 Show transcript tableHide transcript table
.
1 ATGACATCAGTTTTACAATTCATTCCATTCTCATCTTCAATCGATCCAACTTTTTGGCAT 60 1 ATGACATCAGTTTTACAATTCATTCCATTCTCATCTTCAATCGATCCAACTTTTTGGCAT 60 1 -M--T--S--V--L--Q--F--I--P--F--S--S--S--I--D--P--T--F--W--H- 20 61 ACATTAACGAAATTAAAAATTGATGTATTAAAATTAGGAGATCAACCGATTCCTATCAAA 120 61 ACATTAACGAAATTAAAAATTGATGTATTAAAATTAGGAGATCAACCGATTCCTATCAAA 120 21 -T--L--T--K--L--K--I--D--V--L--K--L--G--D--Q--P--I--P--I--K- 40 121 GGGATATATGAAAGAGGTAGATGGGTAAAAGATAAAGAACATCATCTTGGAAAAGAAATT 180 121 GGGATATATGAAAGAGGTAGATGGGTAAAAGATAAAGAACATCATCTTGGAAAAGAAATT 180 41 -G--I--Y--E--R--G--R--W--V--K--D--K--E--H--H--L--G--K--E--I- 60 181 GGATTAGGTGGTGAGATTAGATTGGATGGGAAATCATTTGATTTGGAAATATCGGAGTCT 240 181 GGATTAGGTGGTGAGATTAGATTGGATGGGAAATCATTTGATTTGGAAATATCGGAGTCT 240 61 -G--L--G--G--E--I--R--L--D--G--K--S--F--D--L--E--I--S--E--S- 80 241 AGTCTTTCAACTTTGAATGATAGAGTGACTATGTTTGGTGTCTTGAAGAATTTTAATACG 300 241 AGTCTTTCAACTTTGAATGATAGAGTGACTATGTTTGGTGTCTTGAAGAATTTTAATACG 300 81 -S--L--S--T--L--N--D--R--V--T--M--F--G--V--L--K--N--F--N--T- 100 301 ATTGAAGAATTTAAAGCTTGTGATAAACAATCACTTTTTAATCAATATGCAGATGAAATG 360 301 ATTGAAGAATTTAAAGCTTGTGATAAACAATCACTTTTTAATCAATATGCAGATGAAATG 360 101 -I--E--E--F--K--A--C--D--K--Q--S--L--F--N--Q--Y--A--D--E--M- 120 361 TGGAATTCATTAGGACAAGTCGAAAGTTTTCAAACCAAATCACCTACATTTTTAGTCATA 420 361 TGGAATTCATTAGGACAAGTCGAAAGTTTTCAAACCAAATCACCTACATTTTTAGTCATA 420 121 -W--N--S--L--G--Q--V--E--S--F--Q--T--K--S--P--T--F--L--V--I- 140 421 ACTTTTTCAGATTTAAAAAAATATAAATATTTTTATTGGTTTGCATATCCAGCTTTCATA 480 421 ACTTTTTCAGATTTAAAAAAATATAAATATTTTTATTGGTTTGCATATCCAGCTTTCATA 480 141 -T--F--S--D--L--K--K--Y--K--Y--F--Y--W--F--A--Y--P--A--F--I- 160 481 GCAAAACCATCTTGGATGAATGTAGGAAATCAAGGAGTTTGGTCAGATTTCAATTCAAAT 540 481 GCAAAACCATCTTGGATGAATGTAGGAAATCAAGGAGTTTGGTCAGATTTCAATTCAAAT 540 161 -A--K--P--S--W--M--N--V--G--N--Q--G--V--W--S--D--F--N--S--N- 180 541 GAAACACATGAGATTCAAAATCTTTTAAATCAATCGAATTCATTTGATTTAGAAATTTTT 600 541 GAAACACATGAGATTCAAAATCTTTTAAATCAATCGAATTCATTTGATTTAGAAATTTTT 600 181 -E--T--H--E--I--Q--N--L--L--N--Q--S--N--S--F--D--L--E--I--F- 200 601 AAGGGAAATTGGATTGGGAAAAAGTTGAATGGGAAATGGGTTTTGGATTCTACTCGATCT 660 601 AAGGGAAATTGGATTGGGAAAAAGTTGAATGGGAAATGGGTTTTGGATTCTACTCGATCT 660 201 -K--G--N--W--I--G--K--K--L--N--G--K--W--V--L--D--S--T--R--S- 220 661 TGGCACAAGTTTTTTGAAGGAGTTTTACCAATAGATCGTTACCTTTTCTTTATTGATCCT 720 661 TGGCACAAGTTTTTTGAAGGAGTTTTACCAATAGATCGTTACCTTTTCTTTATTGATCCT 720 221 -W--H--K--F--F--E--G--V--L--P--I--D--R--Y--L--F--F--I--D--P- 240 721 TCTGCTCATCCTCAAGCTGTTGGTTGGCCACTCCGAAACTTATTAGCTGAACTCAACAAA 780 721 TCTGCTCATCCTCAAGCTGTTGGTTGGCCACTCCGAAACTTATTAGCTGAACTCAACAAA 780 241 -S--A--H--P--Q--A--V--G--W--P--L--R--N--L--L--A--E--L--N--K- 260 781 CTACATGGTTCAGATGCTCGTCATTTTCAAGTGGTTGCTTTTAGAGATCCGTTAACTTCA 840 781 CTACATGGTTCAGATGCTCGTCATTTTCAAGTGGTTGCTTTTAGAGATCCGTTAACTTCA 840 261 -L--H--G--S--D--A--R--H--F--Q--V--V--A--F--R--D--P--L--T--S- 280 841 AAGCCAAATATGACGGTGACCAGAAGTTTGATAACTACGATCGAATTACCTGATCAAGAA 900 841 AAGCCAAATATGACGGTGACCAGAAGTTTGATAACTACGATCGAATTACCTGATCAAGAA 900 281 -K--P--N--M--T--V--T--R--S--L--I--T--T--I--E--L--P--D--Q--E- 300 901 CCTCAATCTACTGGAAGGCCAAGTGCAATCGGATGGGAAAAAAACTCGGCTGGTAAACTT 960 901 CCTCAATCTACTGGAAGGCCAAGTGCAATCGGATGGGAAAAAAACTCGGCTGGTAAACTT 960 301 -P--Q--S--T--G--R--P--S--A--I--G--W--E--K--N--S--A--G--K--L- 320 961 GGTCCTAAGATGGCAGATCTAGGACCGATGATGGATCCAACAAGACTCGCTGATCAAGCT 1020 961 GGTCCTAAGATGGCAGATCTAGGACCGATGATGGATCCAACAAGACTCGCTGATCAAGCT 1020 321 -G--P--K--M--A--D--L--G--P--M--M--D--P--T--R--L--A--D--Q--A- 340 1021 GTAGACTTGAATTTGAAATTGATGAGATGGAGAATCCTACCGGATTTGAATTTGGATAAG 1080 1021 GTAGACTTGAATTTGAAATTGATGAGATGGAGAATCCTACCGGATTTGAATTTGGATAAG 1080 341 -V--D--L--N--L--K--L--M--R--W--R--I--L--P--D--L--N--L--D--K- 360 1081 ATTGCTTCGGCTCGATGTTTACTGTTAGGAGCTGGAACGTTGGGATGTTATGTGGCACGT 1140 1081 ATTGCTTCGGCTCGATGTTTACTGTTAGGAGCTGGAACGTTGGGATGTTATGTGGCACGT 1140 361 -I--A--S--A--R--C--L--L--L--G--A--G--T--L--G--C--Y--V--A--R- 380 1141 ACATTGATGGCATGGGGAGTACGAAAGATCACTTTTGTAGATTCTTCGACTGTTTCATTT 1200 1141 ACATTGATGGCATGGGGAGTACGAAAGATCACTTTTGTAGATTCTTCGACTGTTTCATTT 1200 381 -T--L--M--A--W--G--V--R--K--I--T--F--V--D--S--S--T--V--S--F- 400 1201 TCCAATCCAGTTCGACAACCATTGTTTGAATTTAATGATTGTCTTGAAGGAGGAAAACCT 1260 1201 TCCAATCCAGTTCGACAACCATTGTTTGAATTTAATGATTGTCTTGAAGGAGGAAAACCT 1260 401 -S--N--P--V--R--Q--P--L--F--E--F--N--D--C--L--E--G--G--K--P- 420 1261 AAAGCAGCTTGCGCTGCAGCTTCACTCAAAAGGATTTATCCAGGTGTGGATGCCACAGGA 1320 1261 AAAGCAGCTTGCGCTGCAGCTTCACTCAAAAGGATTTATCCAGGTGTGGATGCCACAGGA 1320 421 -K--A--A--C--A--A--A--S--L--K--R--I--Y--P--G--V--D--A--T--G- 440 1321 ATCCAAATGTCAATTCCTATGCCTGGTCATCCAATCCCGGCTCATTTAGTCGATCAAGTT 1380 1321 ATCCAAATGTCAATTCCTATGCCTGGTCATCCAATCCCGGCTCATTTAGTCGATCAAGTT 1380 441 -I--Q--M--S--I--P--M--P--G--H--P--I--P--A--H--L--V--D--Q--V- 460 1381 CAAAAAGATGTGAAACGATTAGAAGATTTGTTTGATGAACATGATGTGATTTATCTTTTG 1440 1381 CAAAAAGATGTGAAACGATTAGAAGATTTGTTTGATGAACATGATGTGATTTATCTTTTG 1440 461 -Q--K--D--V--K--R--L--E--D--L--F--D--E--H--D--V--I--Y--L--L- 480 1441 ATGGATTCGCGTGAAAGTCGATGGTTACCCACTGTCTTAGGAGCAAGTAAACGAAAATTG 1500 1441 ATGGATTCGCGTGAAAGTCGATGGTTACCCACTGTCTTAGGAGCAAGTAAACGAAAATTG 1500 481 -M--D--S--R--E--S--R--W--L--P--T--V--L--G--A--S--K--R--K--L- 500 1501 GTCATGAATGCTGCACTTGGATTTGATTCTTATTTGGTGATGAGACATGGTGTAAGGTCT 1560 1501 GTCATGAATGCTGCACTTGGATTTGATTCTTATTTGGTGATGAGACATGGTGTAAGGTCT 1560 501 -V--M--N--A--A--L--G--F--D--S--Y--L--V--M--R--H--G--V--R--S- 520 1561 TCAAAGAATAAGACTTTATCTGGATCCGATTCATTGGGTTCTTCAACTTCACCTGCCATC 1620 1561 TCAAAGAATAAGACTTTATCTGGATCCGATTCATTGGGTTCTTCAACTTCACCTGCCATC 1620 521 -S--K--N--K--T--L--S--G--S--D--S--L--G--S--S--T--S--P--A--I- 540 1621 CAACAATTAGGTTGTTACTTTTGTAATGATATCGTGGCTCCTACAGATTCTTTAACTGAT 1680 1621 CAACAATTAGGTTGTTACTTTTGTAATGATATCGTGGCTCCTACAGATTCTTTAACTGAT 1680 541 -Q--Q--L--G--C--Y--F--C--N--D--I--V--A--P--T--D--S--L--T--D- 560 1681 CGAACTTTGGATCAAATGTGTACGGTCACTCGACCTGGATTGGCTGCGATTGCTAGTGCA 1740 1681 CGAACTTTGGATCAAATGTGTACGGTCACTCGACCTGGATTGGCTGCGATTGCTAGTGCA 1740 561 -R--T--L--D--Q--M--C--T--V--T--R--P--G--L--A--A--I--A--S--A- 580 1741 ACAGTAGTAGAAGTGATGGCATCAGTTTTACAACATCCAGATGGACCAGAAGCTATGAGT 1800 1741 ACAGTAGTAGAAGTGATGGCATCAGTTTTACAACATCCAGATGGACCAGAAGCTATGAGT 1800 581 -T--V--V--E--V--M--A--S--V--L--Q--H--P--D--G--P--E--A--M--S- 600 1801 GAAGTACCAAATTTAAAAAAAGATGAACCGAATCAAGAAACAGTGAAGGAAAAAAAAGAG 1860 1801 GAAGTACCAAATTTAAAAAAAGATGAACCGAATCAAGAAACAGTGAAGGAAAAAAAAGAG 1860 601 -E--V--P--N--L--K--K--D--E--P--N--Q--E--T--V--K--E--K--K--E- 620 1861 GTATCTTCTTCTGTATTGGGTGATGTACCACATCAGATTAGAGGATTTCTTTCAAAGTTT 1920 1861 GTATCTTCTTCTGTATTGGGTGATGTACCACATCAGATTAGAGGATTTCTTTCAAAGTTT 1920 621 -V--S--S--S--V--L--G--D--V--P--H--Q--I--R--G--F--L--S--K--F- 640 1921 GAAAGTATGAAATTAGTTGGACCTGCTTATGAGAAATGTACAGGTTGTAGTGAATCAGTT 1980 1921 GAAAGTATGAAATTAGTTGGACCTGCTTATGAGAAATGTACAGGTTGTAGTGAATCAGTT 1980 641 -E--S--M--K--L--V--G--P--A--Y--E--K--C--T--G--C--S--E--S--V- 660 1981 GTAAAAGCTTATGAATCAAAAGGATTTGAAATGATCAAAGAAGTTTTAAATGAAGTGAAA 2040 1981 GTAAAAGCTTATGAATCAAAAGGATTTGAAATGATCAAAGAAGTTTTAAATGAAGTGAAA 2040 661 -V--K--A--Y--E--S--K--G--F--E--M--I--K--E--V--L--N--E--V--K- 680 2041 TATTTAGAAAAACTTACAGGATTAGATTTGCTTTATGATGAAAGTGAAGCTATGATGGAA 2100 2041 TATTTAGAAAAACTTACAGGATTAGATTTGCTTTATGATGAAAGTGAAGCTATGATGGAA 2100 681 -Y--L--E--K--L--T--G--L--D--L--L--Y--D--E--S--E--A--M--M--E- 700 2101 AAAGTAGATTGGGATGAAGATGATGATGAATTATGATGGATTGATTGATTGATTTTTTTT 2160 2101 AAAGTAGATTGGGATGAAGATGATGATGAATTATGA........................ 2136 701 -K--V--D--W--D--E--D--D--D--E--L--*-........................ 711 2161 CAAGAAGCGGAAAAAGGTTTTAAAATTTTTTGGATCTTTATATATGATGAAATTAAATGA 2220 ............................................................ ............................................................ 2221 AATCAAATGAAATGAAAACTTGTTGGAAACATATAAGATATGAAATGATGTGAATTGGTT 2280 ............................................................ ............................................................ 2281 TTTTCTTTGGTATGGGTTTGGTTTGAGTTGATTTTCTTTTAGTTTTTTTTTCTTTCTTGG 2340 ............................................................ ............................................................ 2341 AATTGGTGTTTAGAAGGAAGGACAAGATAGATGTTTATCATTAGGTTATATTGGTTTGTG 2400 ............................................................ ............................................................ 2401 TTATTCGAAATTGATTGGTTTGAAAAGATTAGGTTTATGATTATGTCACCAAAGATAGGC 2460 ............................................................ ............................................................ 2461 TTACCTTTTCT 2471 ........... ...........
.
.
Ensembl Fungi release 60 - October 2024 © EMBL-EBI EMBL-EBI
.
.
![[RSS logo]](/i/rss_icon_16.png "Ensembl blog"){kind=icon}
![[twitter logo]](/i/twitter.png "Follow us on Twitter!")
