Melampsora larici-populina (GCA_000204055.1)
Description

hypothetical protein

About this transcript

This transcript has 5 exons and is annotated with 10 domains and features.

Gene
Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • RefSeq
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
MELLADRAFT_106613-1EGG06647540179aa
 
Protein coding
F4RM27 -Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGCATAACCCTCGATCTCAAGCTACAACAGCACTCAAAAGATTAATGACAGAATATCGA     60
     1 ATGCATAACCCTCGATCTCAAGCTACAACAGCACTCAAAAGATTAATGACAGAATATCGA     60
     1 -M--H--N--P--R--S--Q--A--T--T--A--L--K--R--L--M--T--E--Y--R-     20

                                                                          
    61 CAATTAAATAATAAATCATCAAAACAATCAACATCTGAAGAAGAAGTTATGTTTGTGGCA    120
    61 CAATTAAATAATAAATCATCAAAACAATCAACATCTGAAGAAGAAGTTATGTTTGTGGCA    120
    21 -Q--L--N--N--K--S--S--K--Q--S--T--S--E--E--E--V--M--F--V--A-     40

                                                                          
   121 GGTCCTATATCAGAATCAGATTTTTTTATATGGGAAGCTTTAATTTCAGGTCCAGAAGAT    180
   121 GGTCCTATATCAGAATCAGATTTTTTTATATGGGAAGCTTTAATTTCAGGTCCAGAAGAT    180
    41 -G--P--I--S--E--S--D--F--F--I--W--E--A--L--I--S--G--P--E--D-     60

                                                                          
   181 ACACCATACGAAGGAGGTATCTTTACAGCAACCTTAACCTTTCCTCGAGATTATCCACTC    240
   181 ACACCATACGAAGGAGGTATCTTTACAGCAACCTTAACCTTTCCTCGAGATTATCCACTC    240
    61 -T--P--Y--E--G--G--I--F--T--A--T--L--T--F--P--R--D--Y--P--L-     80

                                                                          
   241 TCACCACCTAAAATGACATTCAAACCACCTTTATTACATCCAAATGTTTATACGAATGGT    300
   241 TCACCACCTAAAATGACATTCAAACCACCTTTATTACATCCAAATGTTTATACGAATGGT    300
    81 -S--P--P--K--M--T--F--K--P--P--L--L--H--P--N--V--Y--T--N--G-    100

                                                                          
   301 GAAGTTTGTATTTCGATTTTACATCCACCTGGTGATGATCCAAATCAATATGAATCGGCA    360
   301 GAAGTTTGTATTTCGATTTTACATCCACCTGGTGATGATCCAAATCAATATGAATCGGCA    360
   101 -E--V--C--I--S--I--L--H--P--P--G--D--D--P--N--Q--Y--E--S--A-    120

                                                                          
   361 TCTGAACGTTGGTCACCTGTACAATCAGTTGAAAAAATCTTATTAAGTGTCATCAGTATG    420
   361 TCTGAACGTTGGTCACCTGTACAATCAGTTGAAAAAATCTTATTAAGTGTCATCAGTATG    420
   121 -S--E--R--W--S--P--V--Q--S--V--E--K--I--L--L--S--V--I--S--M-    140

                                                                          
   421 TTAGCTGAACCTAATATCGAAAGTGGTGCGAATATTGAATGTTGTAAATTGTTTAGAGAA    480
   421 TTAGCTGAACCTAATATCGAAAGTGGTGCGAATATTGAATGTTGTAAATTGTTTAGAGAA    480
   141 -L--A--E--P--N--I--E--S--G--A--N--I--E--C--C--K--L--F--R--E-    160

                                                                          
   481 GATAAAAAACAGTATGAGAATAGTGTAAGACAATTTGTTAGACAACAACTTGAGATTTGA    540
   481 GATAAAAAACAGTATGAGAATAGTGTAAGACAATTTGTTAGACAACAACTTGAGATTTGA    540
   161 -D--K--K--Q--Y--E--N--S--V--R--Q--F--V--R--Q--Q--L--E--I--*-    179