We need your help! Has Ensembl saved you time or effort? Please take 15 minutes to fill in a survey and help EMBL-EBI make the case for why open data resources are critical to life science research.
https://www.surveymonkey.com/r/QGFMBH8?channel=[webpage]

In this section

Statistics on protein trees

The protein tree pipeline is described at the following page.

This page provides a summary of the Ensembl phylogenetic analysis of protein families. The following views are available:

Statistics about the gene tree nodes

Species# Nodes# speciation nodes# duplication nodes# dubious nodesNode typesAverage duplication confidence scoreAverage duplication confidence score (non-dubious nodes)
Fungi (Fungi)217341176449335037
6.8 %13.8 %
Fungi incertae sedis232562002813301898
11.3 %27.4 %
Cryptomycota incertae sedis900890100
65.0 %65.0 %
Microsporidians (Microsporidia)733751972581882
4.2 %35.2 %
Pleistophoridae200518991060
79.2 %79.2 %
Apansporoblastina2521236820133
5.2 %40.1 %
Enterocytozoonidae21382119190
75.4 %75.4 %
Nosematidae32732340
62.5 %62.5 %
Microsporidia incertae sedis1288127990
48.1 %48.1 %
Chytridiomycota incertae sedis74987162236100
33.0 %47.0 %
Neocallimastigaceae189661569432720
73.5 %73.5 %
Chytridiomycetes372035921280
65.1 %65.1 %
Mucoromycotan fungi (Mucoromycota)4831459017467
27.6 %38.2 %
Mortierellaceae10540862319170
77.5 %77.5 %
Mucoromycotina3331309921715
50.6 %54.1 %
Pin molds (Mucorales)28704248863671147
49.7 %51.7 %
Lichtheimia10630908815420
84.9 %84.9 %
Cunninghamellaceae736471322320
71.3 %71.3 %
Mucorineae170621608195922
55.6 %56.9 %
Rhizopus769471475470
67.3 %67.3 %
Dikarya237621308753025373
5.5 %11.0 %
Basidiomycete fungi (Basidiomycota)217951789613562543
5.6 %16.1 %
Ustilaginomycotina67635819226718
7.6 %31.8 %
Exobasidiomycetidae (Exobasidiomycetes)2015919828137194
18.3 %44.2 %
Microstromatales incertae sedis46114590210
61.9 %61.9 %
Exobasidiales46434596470
68.1 %68.1 %
Smut fungi (Ustilaginales)79635370662527
1.2 %47.1 %
Ustilaginaceae27672234461234103
1.4 %47.2 %
Pseudozyma626200
0.0 %0.0 %
Ustilago2214220860
58.3 %58.3 %
Pucciniomycotina795578449516
33.8 %39.5 %
Rust fungi (Pucciniales)557551064654
62.1 %62.7 %
Puccinia3464130755386323
60.5 %60.8 %
Puccinia graminis f. sp. tritici149841151834660
77.1 %77.1 %
Microbotryomycetes110961068040511
55.6 %57.2 %
Rhodotorula20291990390
69.2 %69.2 %
Hymenomycetes (Agaricomycotina)154791194413412194
6.9 %18.2 %
Tremellomycetidae (Tremellomycetes)5527524122759
35.1 %44.2 %
Jelly fungi (Tremellales)1252412045365114
38.3 %50.3 %
Cryptococcaceae53855331540
61.1 %61.1 %
Dacrymycetaceae86637347128828
72.5 %74.1 %
Calocera835977935660
73.8 %73.8 %
Agaricomycetes5763028853806620711
5.6 %20.1 %
Agaricomycetes incertae sedis461704386011121198
17.9 %37.1 %
Sistotremastrum136081061529930
88.6 %88.6 %
Russulales44744383910
60.1 %60.1 %
Gloeophyllaceae828176806010
74.4 %74.4 %
Hymenochaetales10510050
60.0 %60.0 %
Serendipita713465146200
77.9 %77.9 %
Cantharellales64756378970
61.2 %61.2 %
Polyporales63911614152296200
43.5 %47.3 %
Phanerochaetaceae781973484710
74.7 %74.7 %
Fomitopsis883681037330
76.5 %76.5 %
Bracket fungi (Polyporaceae)126571155011007
64.4 %64.8 %
Trametes812174996220
71.4 %71.4 %
Agaricomycetidae343792979719122670
12.1 %28.9 %
Boletales243222156815851169
24.0 %41.7 %
Coniophorineae31243101230
52.2 %52.2 %
Sclerodermatineae8225750170618
59.4 %60.9 %
Pisolithus843175279040
75.7 %75.7 %
Suillineae736568505150
72.7 %72.7 %
Paxillaceae243422491850
63.8 %63.8 %
Gill mushrooms (Agaricales)524074615320104244
9.7 %30.2 %
Marasmiineae129461245938899
36.0 %45.1 %
Omphalotaceae395035523980
68.8 %68.8 %
Physalacriaceae497647961764
65.8 %67.3 %
Armillaria366082958170270
77.0 %77.0 %
Schizophyllineae29552918370
56.8 %56.8 %
Lyophyllaceae55195442770
61.7 %61.7 %
Amanita55365454820
66.5 %66.5 %
Agaricineae28140260611161918
29.2 %52.2 %
Agaricaceae230211190
68.4 %68.4 %
Strophariaceae668165121690
62.7 %62.7 %
Atheliaceae672964033260
66.6 %66.6 %
Ascomycete fungi (Ascomycota)815759705721615
2.9 %10.9 %
saccharomyceta771757431075899
6.3 %11.5 %
Budding yeasts (Saccharomycetales)516024538013954827
5.1 %22.7 %
CTG clade (CUG-Ser1 clade)90778508227342
12.7 %31.8 %
Debaryomycetaceae3599635246268482
14.6 %40.9 %
Candida/Lodderomyces clade69664723612182
1.4 %49.9 %
Candida760575041010
74.9 %74.9 %
Metschnikowiaceae87788747310
50.4 %50.4 %
Candida/Metschnikowiaceae21082051570
55.3 %55.3 %
Trichomonascaceae21502138120
54.2 %54.2 %
Phaffomycetaceae513749809760
34.7 %56.2 %
Cyberlindnera37273690370
64.9 %64.9 %
Wickerhamomyces509049321580
72.5 %72.5 %
Saccharomycetales incertae sedis949400
0.0 %0.0 %
Pichiaceae14901147561378
44.6 %47.2 %
Ogataea48344756780
78.8 %78.8 %
Pichia40894018710
66.2 %66.2 %
Komagataella phaffii GS11548164724920
88.6 %88.6 %
Saccharomycetaceae52805513441316145
37.1 %41.2 %
Zygosaccharomyces47214670510
77.5 %77.5 %
Naumovozyma48224746760
78.9 %78.9 %
Lachancea47524707450
64.4 %64.4 %
Eremothecium40193997220
74.2 %74.2 %
Eremothecium gossypii48154756590
96.6 %96.6 %
Filamentous ascomycetes (Pezizomycotina)179731384522631865
6.5 %11.9 %
Truffles (Tuber)13062126803820
72.1 %72.1 %
leotiomyceta125776723611955133864
4.4 %12.0 %
Dothideomycetes20352184904511411
5.2 %21.7 %
Dothideomycetes incertae sedis4969496171
35.4 %40.5 %
Botryosphaeriaceae797375034700
66.7 %66.7 %
Dothideomycetidae22336206763831277
7.2 %31.3 %
Mycosphaerellales87128349142221
9.6 %24.6 %
Mycosphaerellaceae420114134464621
43.1 %44.5 %
Pseudocercospora71117027840
65.5 %65.5 %
Zymoseptoria856982772920
76.0 %76.0 %
Teratosphaeriaceae1247612437390
49.1 %49.1 %
Cladosporiaceae214431343580080
77.4 %77.4 %
Pleosporales5409937617164714835
2.7 %27.5 %
Pleosporineae3030529852219234
16.1 %33.3 %
Pleosporaceae366003619638024
42.5 %45.2 %
Pyrenophora93979328690
70.3 %70.3 %
Bipolaris1030710209980
62.8 %62.8 %
Didymellaceae79497921280
66.1 %66.1 %
Massarineae91099029800
55.8 %55.8 %
sordariomyceta185881430313672918
5.0 %15.6 %
Sordariomycetes6504241983321719842
2.3 %16.6 %
Xylariales314893103141048
41.0 %45.8 %
Hypoxylaceae83828328540
58.3 %58.3 %
Sordariomycetidae2886028411175274
14.4 %37.1 %
Diaporthales14145140271180
54.1 %54.1 %
Ophiostomataceae1240512336690
50.0 %50.0 %
Sporothrix81198047720
73.6 %73.6 %
Magnaporthales779376321574
51.4 %52.7 %
Rice blast fungus (Pyricularia oryzae)11092107623300
80.6 %80.6 %
Magnaporthaceae783275852470
62.8 %62.8 %
Sordariales1231712230861
53.2 %53.8 %
Sordariaceae814779741730
70.8 %70.8 %
Hypocreomycetidae22761204507111600
6.1 %19.7 %
Hypocreales672405877519486517
5.7 %24.9 %
Ophiocordycipitaceae2480023908274618
13.6 %44.1 %
Ophiocordyceps35783548300
71.7 %71.7 %
Tolypocladium1290112813880
49.6 %49.6 %
Nectriaceae9290885234395
30.1 %38.4 %
Fusarium34919335011149269
34.6 %42.7 %
Fusarium fujikuroi species complex1093810893450
62.2 %62.2 %
Fusarium sambucinum species complex22771225951760
62.1 %62.1 %
Cordycipitaceae242400
0.0 %0.0 %
Hypocreaceae4423441580
45.0 %45.0 %
Trichoderma27504270424620
57.3 %57.3 %
Clavicipitaceae299742960430664
36.2 %43.8 %
Metarhizium68106783270
57.4 %57.4 %
Stachybotrys926189762850
68.8 %68.8 %
Glomerellales731472207717
29.3 %35.7 %
Colletotrichum30315296047110
54.0 %54.0 %
Verticillium115589023250035
36.7 %37.2 %
Verticillium dahliae91979162350
70.0 %70.0 %
Microascales3202319912
11.1 %33.3 %
Microascaceae578056621180
65.7 %65.7 %
Ceratocystidaceae3844384220
75.0 %75.0 %
Leotiomycetes199311511811083705
6.2 %27.1 %
Helotiales63987613942188405
34.3 %40.7 %
Sclerotiniaceae60375975620
66.1 %66.1 %
Drepanopezizaceae6391638650
50.0 %50.0 %
Mollisiaceae11905114804250
64.6 %64.6 %
Ploettnerulaceae904588951500
62.0 %62.0 %
Erysiphaceae47324713181
70.2 %74.1 %
Erysiphe531349643490
80.4 %80.4 %
Eurotiomycetes84917708197586
4.5 %18.0 %
Eurotiomycetidae108139375441997
5.7 %18.7 %
Green and blue molds (Eurotiales)25477229877901700
8.5 %26.8 %
Trichocomaceae53745337343
36.9 %40.2 %
Talaromyces14023138431800
52.8 %52.8 %
Aspergillaceae1632215053450819
10.7 %30.2 %
Aspergillus1781916623371825
10.3 %33.3 %
Aspergillus subgen. Circumdati24471241063650
62.6 %62.6 %
Aspergillus subgen. Fumigati1650316411866
48.9 %52.3 %
Aspergillus fumigatus92589212460
58.7 %58.7 %
Onygenales32165258684935804
2.7 %34.2 %
Dermatophytes (Arthrodermataceae)14447142082390
62.8 %62.8 %
Onygenaceae60145968442
55.1 %57.6 %
Coccidioides75437469740
72.3 %72.3 %
Ajellomycetaceae20066199331330
50.6 %50.6 %
Onygenales incertae sedis39139010
50.0 %50.0 %
Chaetothyriomycetidae10043985010588
15.5 %28.6 %
Black yeasts (Chaetothyriales)8157783625071
25.2 %32.3 %
Herpotrichiellaceae44282434318510
44.4 %44.4 %
Orbiliaceae13939131677720
70.8 %70.8 %
Taphrinomycotina75807550300
40.4 %40.4 %
Pneumocystis65886573150
85.6 %85.6 %
Schizosaccharomyces13542131214210
79.5 %79.5 %