Upcoming Ensembl Platform Transition

This is the final release of its kind on this website.

In summer 2026, this site will bring you to the new Ensembl platform currently at beta.ensembl.org.
Please bookmark this archive to retain access to the current site, tools and functionality until they are available on the new platform -> eg63-fungi.ensembl.org

In this section

Statistics on protein trees

The protein tree pipeline is described at the following page.

This page provides a summary of the Ensembl phylogenetic analysis of protein families. The following views are available:

Statistics about the gene tree nodes

Species# Nodes# speciation nodes# duplication nodes# dubious nodesNode typesAverage duplication confidence scoreAverage duplication confidence score (non-dubious nodes)
Fungi225901196553725253
6.6 %13.1 %
Fungi incertae sedis232642000813331923
11.1 %27.2 %
Microsporidia730651772731856
4.4 %34.5 %
Pleistophoridae202819061220
77.0 %77.0 %
Apansporoblastina2549236726156
4.9 %34.2 %
Nosematidae34033460
66.7 %66.7 %
Enterocytozoonidae115710951250
14.8 %76.4 %
Enterocytozoon96596050
70.0 %70.0 %
Microsporidia incertae sedis13021289130
48.7 %48.7 %
Mucoromycota4842459118170
28.1 %39.0 %
Mortierellaceae10556864119150
77.9 %77.9 %
Mucoromycotina3327309421617
49.7 %53.6 %
Mucorales28705248423706157
49.4 %51.5 %
Mucorineae171141610499218
55.9 %56.9 %
Rhizopus781671856310
67.4 %67.4 %
Cunninghamellaceae736671202460
71.1 %71.1 %
Lichtheimia10646909315530
85.1 %85.1 %
Chytridiomycota incertae sedis7517717924593
33.5 %46.2 %
Chytridiomycetes372835981300
62.2 %62.2 %
Neocallimastigaceae190971576333340
73.5 %73.5 %
Cryptomycota incertae sedis901891100
65.0 %65.0 %
Dikarya244861330855445634
5.5 %11.1 %
Ascomycota829961465601593
2.8 %10.6 %
saccharomyceta8459613811821139
5.6 %10.9 %
Saccharomycotina255411912512265190
3.4 %18.0 %
Dipodascales4482409561326
5.7 %35.9 %
Trichomonascaceae22172200170
58.8 %58.8 %
Dipodascales incertae sedis26432622210
54.8 %54.8 %
Pichiomycetes98379249120468
4.7 %22.9 %
Serinales90158418250347
13.1 %31.3 %
Debaryomycetaceae3605935261299499
15.0 %40.0 %
Candida/Lodderomyces clade69564727732156
1.6 %47.9 %
Candida759074891010
72.8 %72.8 %
Metschnikowiaceae87918745460
47.8 %47.8 %
Candidozyma21122053590
55.6 %55.6 %
Pichiaceae14774146111576
43.9 %45.6 %
Komagataella phaffii GS11548144724900
89.4 %89.4 %
Pichia40864018680
64.7 %64.7 %
Ogataea48484766820
79.3 %79.3 %
Saccharomycetes8699852112454
17.3 %24.8 %
Saccharomycetaceae52783513371305141
37.9 %42.0 %
Naumovozyma48524767850
79.4 %79.4 %
Lachancea47554710450
63.3 %63.3 %
Zygosaccharomyces47274673540
79.6 %79.6 %
Eremothecium40143992220
77.3 %77.3 %
Phaffomycetales5242506511166
34.1 %54.4 %
Cyberlindnera37163674420
63.1 %63.1 %
Wickerhamomyces509049321580
72.2 %72.2 %
Pezizomycotina180101380822911911
6.4 %11.7 %
Tuber13113127044090
72.1 %72.1 %
leotiomyceta126110723931978733930
4.4 %12.0 %
sordariomyceta186811425314352993
5.1 %15.6 %
Leotiomycetes199791518211203677
6.4 %27.3 %
Erysiphaceae47284708200
73.3 %73.3 %
Erysiphe534749643830
78.7 %78.7 %
Helotiales64056614432212401
34.4 %40.6 %
Drepanopezizaceae6394638950
60.0 %60.0 %
Ploettnerulaceae904788911560
62.5 %62.5 %
Mollisiaceae11890114674230
64.5 %64.5 %
Sclerotiniaceae60415971700
64.3 %64.3 %
Sordariomycetes6589942338336120200
2.3 %16.4 %
Hypocreomycetidae22765204667331566
6.3 %19.9 %
Glomerellales729572018014
27.4 %32.2 %
Verticillium116109051251049
36.5 %37.2 %
Verticillium dahliae91729131410
67.1 %67.1 %
Colletotrichum30304295867180
55.1 %55.1 %
Hypocreales672345878519676482
5.7 %24.4 %
Ophiocordycipitaceae2479723879294624
14.0 %43.6 %
Ophiocordyceps35833563200
67.5 %67.5 %
Tolypocladium1289912817820
52.6 %52.6 %
Hypocreaceae44274413131
49.3 %53.1 %
Trichoderma27497270374600
58.1 %58.1 %
Stachybotrys928889863020
69.0 %69.0 %
Cordycipitaceae272700
0.0 %0.0 %
Clavicipitaceae299512953735163
37.2 %43.9 %
Metarhizium68086784240
54.2 %54.2 %
Nectriaceae9313886335298
29.2 %37.4 %
Fusarium34954335241157273
34.9 %43.1 %
Fusarium sambucinum species complex22773225941790
61.4 %61.4 %
Fusarium fujikuroi species complex1093910898410
62.2 %62.2 %
Microascales3213321120
50.0 %50.0 %
Ceratocystidaceae3841383650
60.0 %60.0 %
Microascaceae577356571160
62.9 %62.9 %
Sordariomycetidae2876728316197254
15.3 %35.0 %
Diaporthales14149140321170
52.4 %52.4 %
Ophiostomataceae1239612326691
48.8 %49.5 %
Sporothrix81188042760
71.1 %71.1 %
Sordariales1230912213951
53.3 %53.9 %
Sordariaceae815779741830
70.8 %70.8 %
Magnaporthales755773931604
52.2 %53.5 %
Magnaporthaceae784675832630
62.5 %62.5 %
Xylariomycetidae100519362209480
11.3 %37.4 %
Amphisphaeriales66026555470
56.4 %56.4 %
Xylariales141841401513534
36.4 %45.6 %
Hypoxylaceae83698324450
60.0 %60.0 %
Dothideomycetes20271184504451376
5.5 %22.4 %
Pleosporales373223424213311749
12.6 %29.2 %
Massarineae75387477610
54.9 %54.9 %
Pleosporineae4041339352535526
14.7 %29.1 %
Pleosporaceae366743625739423
42.5 %45.0 %
Pyrenophora94039332710
68.3 %68.3 %
Bipolaris1030910212970
63.4 %63.4 %
Phaeosphaeriaceae83688311570
56.1 %56.1 %
Didymellaceae79697931380
57.9 %57.9 %
Dothideomycetidae22375206813931301
7.1 %30.7 %
Mycosphaerellales86448327129188
11.1 %27.4 %
Teratosphaeriaceae1248612441450
50.7 %50.7 %
Mycosphaerellaceae420664138066521
43.2 %44.6 %
Pseudocercospora71147027870
65.5 %65.5 %
Zymoseptoria859482893050
75.4 %75.4 %
Cladosporiaceae215481350180470
77.6 %77.6 %
Dothideomycetes incertae sedis49504933161
38.2 %40.6 %
Botryosphaeriaceae796575054600
66.7 %66.7 %
Eurotiomycetes84497685201563
4.9 %18.6 %
Eurotiomycetidae107949365443986
5.8 %18.8 %
Eurotiales25597230438111743
8.6 %27.1 %
Trichocomaceae53675326365
39.2 %44.7 %
Talaromyces14018138361820
51.6 %51.6 %
Aspergillaceae1630415044463797
10.8 %29.4 %
Aspergillus1787816644386848
10.2 %32.7 %
Aspergillus subgen. Circumdati24449240593900
61.1 %61.1 %
Aspergillus subgen. Fumigati16518164139510
48.9 %54.0 %
Aspergillus fumigatus92599212470
59.6 %59.6 %
Onygenales2529724738440119
26.3 %33.4 %
Arthrodermataceae14452142062460
61.2 %61.2 %
Ajellomycetaceae27452272362160
48.6 %48.6 %
Onygenaceae60275974530
54.4 %54.4 %
Coccidioides758274741080
66.2 %66.2 %
Chaetothyriomycetidae10014981710394
16.3 %31.1 %
Chaetothyriales8180785425868
25.1 %31.8 %
Herpotrichiellaceae44323434448790
44.8 %44.8 %
Orbiliaceae13941131657760
70.2 %70.2 %
Taphrinomycotina74737445280
44.3 %44.3 %
Schizosaccharomyces13533131204130
78.9 %78.9 %
Pneumocystis65856566190
76.3 %76.3 %
Basidiomycota218471786213842601
5.7 %16.4 %
Agaricomycotina155871197813782231
6.9 %18.0 %
Dacrymycetaceae86647330129836
71.1 %73.1 %
Calocera835977825770
73.9 %73.9 %
Tremellomycetes5519523322066
35.6 %46.3 %
Tremellales1253312041362130
37.1 %50.4 %
Cryptococcaceae53835316670
61.9 %61.9 %
Agaricomycetes5759128783808520723
5.6 %19.8 %
Agaricomycetidae340642967319022489
12.3 %28.5 %
Boletales269882400118481139
28.1 %45.3 %
Coniophorineae32353209260
55.8 %55.8 %
Suillineae739068595310
73.3 %73.3 %
Sclerodermatineae8240751071416
60.2 %61.6 %
Pisolithus848875549340
76.1 %76.1 %
Agaricales526064624421024260
9.8 %29.5 %
Schizophyllineae29752936390
61.5 %61.5 %
Marasmiineae129601248237999
37.0 %46.6 %
Omphalotaceae393635373990
68.5 %68.5 %
Physalacriaceae492647601651
66.8 %67.2 %
Armillaria368852969571900
77.1 %77.1 %
Lyophyllaceae55085425830
61.4 %61.4 %
Agaricineae28244261291216899
29.9 %52.0 %
Agaricaceae225205200
65.0 %65.0 %
Strophariaceae671165441670
60.8 %60.8 %
Amanita55125446660
68.2 %68.2 %
Atheliaceae678964433460
66.5 %66.5 %
Agaricomycetes incertae sedis462504396611461138
18.6 %37.1 %
Cantharellales648263651170
58.1 %58.1 %
Gloeophyllaceae832677006260
74.6 %74.6 %
Polyporales63989614172376196
43.6 %47.2 %
Phanerochaetaceae782173474740
74.2 %74.2 %
Fomitopsis886381247390
76.5 %76.5 %
Polyporaceae127081157111298
63.9 %64.4 %
Trametes813575006350
71.1 %71.1 %
Russulales44384354840
61.3 %61.3 %
Hymenochaetales10310030
66.7 %66.7 %
Sistotremastraceae136211064329780
88.4 %88.4 %
Serendipita712765206070
78.6 %78.6 %
Ustilaginomycotina67695816232721
7.7 %31.5 %
Ustilaginales78995368582473
1.1 %46.1 %
Ustilaginaceae2991629059124733
7.6 %52.5 %
Pseudozyma858410
50.0 %50.0 %
Exobasidiomycetes2017419836136202
17.5 %43.6 %
Microstromatales incertae sedis46004579210
61.9 %61.9 %
Exobasidiales46234580430
69.8 %69.8 %
Pucciniomycotina794678428717
33.8 %40.4 %
Microbotryomycetes110931067041310
55.4 %56.7 %
Rhodotorula20271989380
69.7 %69.7 %
Pucciniales559751064865
62.8 %63.5 %
Puccinia334152972036950
63.5 %63.5 %